More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2189 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  75.94 
 
 
399 aa  642    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  82.37 
 
 
397 aa  693    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
397 aa  821    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  74.44 
 
 
399 aa  628  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  55.16 
 
 
397 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  56.49 
 
 
398 aa  460  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  55.42 
 
 
396 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  54.8 
 
 
401 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  52.64 
 
 
397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  53.73 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  51.76 
 
 
398 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  51.25 
 
 
400 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  51.65 
 
 
394 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  52.93 
 
 
395 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  52.54 
 
 
392 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  52.42 
 
 
395 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  52.93 
 
 
395 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  53.81 
 
 
393 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  52.42 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  52.42 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  51.66 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  52.42 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  52.16 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  52.42 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  52.42 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  51.89 
 
 
393 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  51.4 
 
 
395 aa  411  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  52.16 
 
 
395 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  52.82 
 
 
391 aa  408  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  51.52 
 
 
398 aa  411  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  50.38 
 
 
394 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  48.99 
 
 
387 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  51.27 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  48.63 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  50.26 
 
 
395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  48.49 
 
 
398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  49.49 
 
 
389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  50 
 
 
393 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  52.41 
 
 
396 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  48.38 
 
 
400 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  48.63 
 
 
400 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  49.36 
 
 
395 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  48.48 
 
 
397 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  49.74 
 
 
400 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  49.11 
 
 
390 aa  395  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  48.97 
 
 
392 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  48.86 
 
 
388 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 
400 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  49.12 
 
 
400 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  51.28 
 
 
400 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  51.28 
 
 
400 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  49.62 
 
 
400 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  51.03 
 
 
400 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  49.75 
 
 
400 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  45.82 
 
 
399 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  49.87 
 
 
401 aa  382  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  47.88 
 
 
404 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  46.6 
 
 
400 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  49.49 
 
 
400 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  47.47 
 
 
397 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  49.36 
 
 
400 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  48.61 
 
 
400 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  48.72 
 
 
392 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  47.86 
 
 
400 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  48.36 
 
 
400 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  47.98 
 
 
388 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  48.98 
 
 
392 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  48.11 
 
 
400 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  48.21 
 
 
399 aa  372  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  47.98 
 
 
388 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  48.61 
 
 
401 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  45.06 
 
 
406 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  48.61 
 
 
388 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  49.36 
 
 
402 aa  368  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  47.1 
 
 
400 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  46.35 
 
 
392 aa  369  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  47.1 
 
 
400 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  48.34 
 
 
400 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  47.19 
 
 
396 aa  368  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  47.83 
 
 
400 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  46.85 
 
 
400 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  46.8 
 
 
400 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  44.53 
 
 
390 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  49.1 
 
 
402 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  47.33 
 
 
387 aa  367  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  48.11 
 
 
400 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  46.8 
 
 
400 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  45.34 
 
 
405 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  46.85 
 
 
400 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  44.84 
 
 
389 aa  368  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  47.1 
 
 
402 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  48.47 
 
 
402 aa  364  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  46.23 
 
 
402 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  47.1 
 
 
402 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  46.97 
 
 
400 aa  363  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2022  aspartate aminotransferase  46.84 
 
 
393 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1687  aminotransferase class I and II  46.84 
 
 
393 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  48.23 
 
 
398 aa  363  4e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  47.86 
 
 
400 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  47.86 
 
 
400 aa  363  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>