More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3150 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  90.5 
 
 
400 aa  757    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  77.14 
 
 
400 aa  653    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  75.13 
 
 
400 aa  635    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  85.5 
 
 
400 aa  723    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  76.75 
 
 
400 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  100 
 
 
400 aa  830    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  86.75 
 
 
400 aa  732    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  89.25 
 
 
400 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  85.75 
 
 
400 aa  723    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  80 
 
 
400 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  76.13 
 
 
400 aa  648    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  74.5 
 
 
400 aa  636    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  88.5 
 
 
400 aa  745    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  75 
 
 
400 aa  630  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  73.5 
 
 
400 aa  627  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  75.76 
 
 
401 aa  626  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  73 
 
 
400 aa  624  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  72.25 
 
 
400 aa  621  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  75 
 
 
401 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  73.75 
 
 
400 aa  618  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  72.36 
 
 
400 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  74.75 
 
 
400 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  74.24 
 
 
400 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  74.24 
 
 
400 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  73.74 
 
 
400 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  72.75 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  71 
 
 
400 aa  596  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  69.27 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  69.27 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  70.03 
 
 
400 aa  578  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  69.27 
 
 
400 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  68.59 
 
 
400 aa  578  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  68.84 
 
 
400 aa  568  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  65.75 
 
 
400 aa  558  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  64.75 
 
 
400 aa  545  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  61.75 
 
 
400 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  62.69 
 
 
401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  61 
 
 
400 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  58.25 
 
 
400 aa  494  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  59.09 
 
 
410 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  58.48 
 
 
403 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  59.09 
 
 
401 aa  481  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  60.86 
 
 
400 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  56.96 
 
 
409 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  56.92 
 
 
402 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  56.85 
 
 
404 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  56.67 
 
 
402 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  54.78 
 
 
406 aa  458  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  55.58 
 
 
413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  53.77 
 
 
404 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  53.79 
 
 
402 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  55.61 
 
 
402 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  54.2 
 
 
404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  54.48 
 
 
409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  54.66 
 
 
408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  54.04 
 
 
400 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  54.48 
 
 
402 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  54.83 
 
 
411 aa  438  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  52.27 
 
 
398 aa  434  1e-120  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  53.79 
 
 
402 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  55 
 
 
397 aa  429  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  52.02 
 
 
398 aa  429  1e-119  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  52 
 
 
402 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
402 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2591  aspartate aminotransferase  47.75 
 
 
400 aa  408  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  50.9 
 
 
402 aa  411  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  52.43 
 
 
394 aa  408  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  51.9 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0460  aspartate aminotransferase  50 
 
 
402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  50.88 
 
 
400 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  53.16 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  53.3 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  53.05 
 
 
392 aa  398  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  52.69 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  50.77 
 
 
399 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  50 
 
 
399 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  51.65 
 
 
398 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  52.43 
 
 
394 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  50 
 
 
395 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  52.17 
 
 
393 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  51.79 
 
 
391 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  51.17 
 
 
423 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  50.91 
 
 
394 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  51.52 
 
 
398 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  50.89 
 
 
397 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  49.62 
 
 
396 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  51.67 
 
 
393 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0890  aminotransferase class I and II  49.48 
 
 
402 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  48.24 
 
 
388 aa  379  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  49.23 
 
 
397 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  52.96 
 
 
378 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  47.86 
 
 
395 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  46.62 
 
 
398 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  48.47 
 
 
396 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  46.8 
 
 
397 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  48.47 
 
 
399 aa  364  1e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5769  aminotransferase class I and II  49.38 
 
 
423 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274836 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  47.29 
 
 
395 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  49.23 
 
 
402 aa  363  4e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  48.86 
 
 
393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>