More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2545 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  100 
 
 
392 aa  806    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  70.36 
 
 
389 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  68.91 
 
 
388 aa  561  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  66.41 
 
 
387 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  69.69 
 
 
388 aa  531  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  66.41 
 
 
388 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  66.41 
 
 
388 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  63.99 
 
 
390 aa  520  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  52.45 
 
 
393 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  54.21 
 
 
392 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  54.07 
 
 
393 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  51.68 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  54.52 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  51.68 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  55.05 
 
 
396 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  50.25 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 
395 aa  401  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
395 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
395 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
395 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
395 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
395 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 
395 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 
395 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  51.53 
 
 
397 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 
395 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  47.85 
 
 
397 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  47.85 
 
 
397 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  49.62 
 
 
395 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  47.72 
 
 
395 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  50 
 
 
397 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  51.16 
 
 
397 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  51.65 
 
 
393 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  51.28 
 
 
398 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  49.23 
 
 
395 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  48.72 
 
 
399 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  48.97 
 
 
397 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  49.49 
 
 
399 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  47.69 
 
 
397 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07471  aminotransferases class-I  47.91 
 
 
393 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.503554  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  47.77 
 
 
388 aa  385  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
396 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0674  L-aspartate aminotransferase  47.91 
 
 
392 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  46.19 
 
 
395 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  46.91 
 
 
394 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07291  aminotransferases class-I  47.12 
 
 
392 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.122313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  48.21 
 
 
401 aa  382  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  48.3 
 
 
389 aa  383  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  48.56 
 
 
389 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  48.83 
 
 
389 aa  381  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  47.78 
 
 
387 aa  379  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07271  aminotransferases class-I  46.6 
 
 
392 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.232753  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  47.47 
 
 
400 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  48.56 
 
 
389 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  48.34 
 
 
400 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  49.23 
 
 
397 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  47.73 
 
 
400 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  45.71 
 
 
400 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  45.45 
 
 
400 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  46.75 
 
 
392 aa  373  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  48.19 
 
 
389 aa  373  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  46.68 
 
 
400 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  47.19 
 
 
400 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  48.09 
 
 
398 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  47.19 
 
 
400 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  46.72 
 
 
400 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  45.71 
 
 
400 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  47.93 
 
 
392 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  44.95 
 
 
400 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  45.64 
 
 
392 aa  365  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  47.15 
 
 
400 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  46.46 
 
 
400 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  46.46 
 
 
400 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  45.61 
 
 
400 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  46.21 
 
 
401 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  45.45 
 
 
400 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  49.61 
 
 
402 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  46.65 
 
 
394 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  45.71 
 
 
400 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  45.96 
 
 
400 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  46.46 
 
 
400 aa  363  4e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  47.51 
 
 
390 aa  363  4e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  46.21 
 
 
401 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  43.33 
 
 
399 aa  362  7.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  47.31 
 
 
402 aa  362  7.0000000000000005e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  46.88 
 
 
390 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  47.46 
 
 
399 aa  361  1e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  45.69 
 
 
398 aa  361  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  44.62 
 
 
398 aa  361  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  45.92 
 
 
400 aa  360  3e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  45.71 
 
 
400 aa  360  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  48.84 
 
 
393 aa  359  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  48.35 
 
 
412 aa  358  6e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  47.18 
 
 
395 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  45.66 
 
 
397 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  47.18 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  46.37 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  47.36 
 
 
401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  44.19 
 
 
400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  48.04 
 
 
393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>