More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0172 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 403 aa  827    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  75.12 
 
 		 400 aa  606  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  62.12 
 
 		 401 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  63.73 
 
 		 400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  62.97 
 
 		 400 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  61.36 
 
 		 400 aa  511  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  62.97 
 
 		 400 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  61.9 
 
 		 400 aa  507  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  62.97 
 
 		 400 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  61.79 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  62.12 
 
 		 401 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  60.05 
 
 		 400 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  62.41 
 
 		 400 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  61.46 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  60.1 
 
 		 400 aa  497  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  60.45 
 
 		 401 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  59.45 
 
 		 400 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  60.35 
 
 		 400 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  59.85 
 
 		 400 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  58.33 
 
 		 400 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  60.35 
 
 		 400 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  57.83 
 
 		 400 aa  488  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  59.05 
 
 		 400 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  58.48 
 
 		 400 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  58.08 
 
 		 400 aa  491  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  58.08 
 
 		 400 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  58.48 
 
 		 400 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  58.23 
 
 		 400 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  58.23 
 
 		 400 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  57.07 
 
 		 400 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  58.59 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  59.6 
 
 		 400 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  57.32 
 
 		 400 aa  482  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  57.83 
 
 		 400 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  57.83 
 
 		 400 aa  478  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  57.58 
 
 		 400 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  57.07 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  57.04 
 
 		 402 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  57.04 
 
 		 402 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  55.56 
 
 		 400 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  57.54 
 
 		 404 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  57.25 
 
 		 410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  56.03 
 
 		 408 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  54.55 
 
 		 400 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  55.3 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  54.8 
 
 		 409 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  55.53 
 
 		 406 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  55.84 
 
 		 409 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  53.4 
 
 		 401 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  53.98 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  56.15 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  57.07 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  51.9 
 
 		 404 aa  418  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  54.4 
 
 		 413 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  53.18 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  56.63 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  51.24 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  51.79 
 
 		 394 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  50.37 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  54.91 
 
 		 398 aa  411  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  52.7 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  54.92 
 
 		 411 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  52.53 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  51.79 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  51.89 
 
 		 402 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  52.66 
 
 		 393 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  53.38 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  54.18 
 
 		 389 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  51.02 
 
 		 399 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  51.55 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  51.52 
 
 		 398 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  52.07 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  48.24 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  51.29 
 
 		 392 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  54.66 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  51.52 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0460  aspartate aminotransferase  51.15 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  51.91 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  50.5 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  49.37 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  47.98 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  48.56 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2022  aspartate aminotransferase  51.54 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  51.65 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  49.74 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1687  aminotransferase class I and II  51.54 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  48.33 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  48.62 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0890  aminotransferase class I and II  46.92 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5769  aminotransferase class I and II  51.61 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274836 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  49.74 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  47.52 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2591  aspartate aminotransferase  47.09 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  48.47 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  54.38 
 
 		 406 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  51.17 
 
 		 391 aa  368  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  48.09 
 
 		 397 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  47.09 
 
 		 396 aa  362  6e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  47.93 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  49.22 
 
 		 402 aa  358  8e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>