More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2674 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  100 
 
 
393 aa  783    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  59.53 
 
 
392 aa  475  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  56.28 
 
 
399 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  55.87 
 
 
393 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  55.61 
 
 
393 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  51.41 
 
 
387 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2610  aminotransferase class I and II  55.78 
 
 
393 aa  401  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.436935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2719  aminotransferase  55.91 
 
 
392 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  54.97 
 
 
395 aa  401  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4903  aminotransferase class I and II  55.06 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234248  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  55.12 
 
 
392 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  56.05 
 
 
393 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  42.18 
 
 
401 aa  322  6e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  46.88 
 
 
398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  43.26 
 
 
400 aa  315  9e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  42.75 
 
 
389 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  41.41 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  40.98 
 
 
386 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  41.82 
 
 
380 aa  311  2e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  39.95 
 
 
395 aa  308  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  40.05 
 
 
387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  40.35 
 
 
399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  40.1 
 
 
397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  45.32 
 
 
396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  43.52 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  40 
 
 
399 aa  306  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  41.43 
 
 
400 aa  305  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  39.85 
 
 
400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  41.24 
 
 
388 aa  303  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  41.71 
 
 
380 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  43.16 
 
 
398 aa  302  9e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  41.6 
 
 
400 aa  301  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  43.04 
 
 
402 aa  300  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  39.49 
 
 
396 aa  300  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  41.19 
 
 
392 aa  300  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  41.01 
 
 
400 aa  300  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  38.29 
 
 
394 aa  299  5e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  41.18 
 
 
393 aa  299  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  40.75 
 
 
397 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  39.04 
 
 
396 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  40.15 
 
 
392 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  38.82 
 
 
395 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  40.66 
 
 
400 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  41.75 
 
 
388 aa  296  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  40 
 
 
400 aa  295  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  40.82 
 
 
399 aa  295  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  39.75 
 
 
400 aa  295  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  42.11 
 
 
397 aa  295  8e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  39.95 
 
 
396 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  39.75 
 
 
400 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  38.82 
 
 
395 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  38.82 
 
 
395 aa  294  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  38.82 
 
 
395 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  43.72 
 
 
387 aa  294  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  38.82 
 
 
395 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  38.3 
 
 
395 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  38.19 
 
 
395 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  38.82 
 
 
395 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  41.6 
 
 
400 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  39.95 
 
 
400 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  38.3 
 
 
395 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  38.05 
 
 
395 aa  293  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  40.51 
 
 
400 aa  292  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  40 
 
 
400 aa  292  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  37.79 
 
 
395 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  39.35 
 
 
400 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  41.35 
 
 
400 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  40.91 
 
 
394 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  41.35 
 
 
400 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  39.2 
 
 
397 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  38.94 
 
 
400 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  39.65 
 
 
395 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  39.3 
 
 
400 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  41.79 
 
 
392 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  38.69 
 
 
400 aa  290  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  42.62 
 
 
370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  38.73 
 
 
394 aa  289  7e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  41.01 
 
 
391 aa  289  7e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  38.99 
 
 
400 aa  289  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  39 
 
 
400 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  41.37 
 
 
390 aa  288  9e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  39.24 
 
 
400 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  39.6 
 
 
400 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  39.25 
 
 
400 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  38.01 
 
 
409 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  40.45 
 
 
400 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  37.63 
 
 
410 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  37.11 
 
 
400 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  38.99 
 
 
400 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  38.99 
 
 
400 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  40.85 
 
 
375 aa  286  5.999999999999999e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  39.8 
 
 
405 aa  285  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  41.9 
 
 
412 aa  285  8e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  39.69 
 
 
388 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  39.69 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  39.34 
 
 
398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  41.51 
 
 
384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  38.31 
 
 
398 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  43.19 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  39.1 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>