More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2582 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 393 aa  795    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4903  aminotransferase class I and II  86.2 
 
 		 392 aa  673    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234248  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  83.33 
 
 		 392 aa  667    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  86.26 
 
 		 393 aa  682    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2610  aminotransferase class I and II  90.05 
 
 		 393 aa  706    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.436935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  98.47 
 
 		 393 aa  786    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  76.61 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2719  aminotransferase  75.26 
 
 		 392 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  55.61 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  52.28 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  48.81 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  44.53 
 
 		 387 aa  350  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  43.01 
 
 		 387 aa  286  5e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  40.41 
 
 		 384 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  38.86 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  38.66 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  38.73 
 
 		 399 aa  276  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  38.56 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  36.9 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  38.36 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  37.37 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  38.96 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  36.83 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  38.76 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  39.11 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  38.1 
 
 		 399 aa  269  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  37.85 
 
 		 398 aa  269  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  38.94 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  41.19 
 
 		 411 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  37.77 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  42.66 
 
 		 367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  36.95 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  38.04 
 
 		 398 aa  266  7e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  39.35 
 
 		 405 aa  266  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  38.89 
 
 		 379 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  38.38 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  38.87 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  36.46 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  36.57 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  39.95 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  36.81 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  34.68 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  38.46 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  39.57 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  40.47 
 
 		 396 aa  263  4.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  36.13 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  36.54 
 
 		 392 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  37.05 
 
 		 392 aa  262  6.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  39.94 
 
 		 397 aa  262  8e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  38.52 
 
 		 380 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  37.33 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  38.89 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  39.66 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  38.11 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  37.53 
 
 		 393 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  38.16 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  38.89 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  39.78 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  38.94 
 
 		 406 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  41.31 
 
 		 412 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  37.08 
 
 		 400 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  37.84 
 
 		 400 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  37.08 
 
 		 400 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  35.98 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  35.77 
 
 		 386 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  37.1 
 
 		 388 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  37.69 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  37.79 
 
 		 393 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  35.45 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  35.45 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  35.45 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  36.69 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  35.45 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  35.45 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  37.43 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  36.98 
 
 		 409 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  40.1 
 
 		 414 aa  256  6e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  39.49 
 
 		 400 aa  255  7e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  36.84 
 
 		 400 aa  255  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  36.04 
 
 		 401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  35.88 
 
 		 400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  39.06 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  36.32 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  35.19 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  38.19 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  35 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  39.06 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  35.19 
 
 		 395 aa  254  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  36.78 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  36.76 
 
 		 397 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  38.27 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  36.92 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  35.05 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  36.84 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  35.43 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  35 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  37.19 
 
 		 391 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  38.44 
 
 		 402 aa  251  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  35.81 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  34.92 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>