More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0707 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  100 
 
 
392 aa  808    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  99.49 
 
 
392 aa  806    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  75.13 
 
 
387 aa  628  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  71.58 
 
 
390 aa  609  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  63.59 
 
 
407 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  57.92 
 
 
386 aa  484  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  55.7 
 
 
388 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  56.17 
 
 
399 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  54.66 
 
 
397 aa  464  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  53.74 
 
 
387 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  55.82 
 
 
390 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  55.78 
 
 
401 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  54.86 
 
 
391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  56.53 
 
 
393 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  54.26 
 
 
396 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  54.28 
 
 
396 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  54.28 
 
 
396 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  54.28 
 
 
396 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  54.28 
 
 
396 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  54.01 
 
 
396 aa  441  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  52.22 
 
 
405 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  54.28 
 
 
396 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  54.28 
 
 
396 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  54.01 
 
 
396 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  53 
 
 
404 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  53.99 
 
 
396 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  52.36 
 
 
396 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  53.48 
 
 
396 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  52.71 
 
 
388 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  53.79 
 
 
390 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  53.17 
 
 
402 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  52.09 
 
 
393 aa  428  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  52.14 
 
 
386 aa  426  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  49.36 
 
 
398 aa  425  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  50.52 
 
 
398 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  50 
 
 
398 aa  422  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  50.26 
 
 
385 aa  424  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  50.79 
 
 
388 aa  421  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  52.33 
 
 
391 aa  418  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 
386 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  48.42 
 
 
400 aa  412  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  52.34 
 
 
393 aa  413  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  50.79 
 
 
387 aa  411  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  51.17 
 
 
387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  51.31 
 
 
386 aa  404  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 
410 aa  401  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  50 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  50.27 
 
 
383 aa  398  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  50.79 
 
 
381 aa  395  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  49.6 
 
 
385 aa  395  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  50 
 
 
381 aa  398  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
385 aa  392  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  46.27 
 
 
395 aa  388  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
380 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  43.26 
 
 
385 aa  348  7e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  43.23 
 
 
387 aa  346  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  43.23 
 
 
387 aa  345  7e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  43.23 
 
 
387 aa  344  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  43.23 
 
 
387 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  42.71 
 
 
387 aa  342  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  42.45 
 
 
387 aa  342  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  42.97 
 
 
387 aa  342  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  42.97 
 
 
387 aa  342  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  41.45 
 
 
387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  42.67 
 
 
387 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  42.04 
 
 
391 aa  317  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  39.79 
 
 
398 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  41.76 
 
 
387 aa  308  9e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  38.38 
 
 
382 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  38.83 
 
 
380 aa  306  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  41.25 
 
 
399 aa  306  3e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  38.83 
 
 
380 aa  306  6e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  38.9 
 
 
385 aa  298  9e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  40.7 
 
 
401 aa  298  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  39.95 
 
 
370 aa  290  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  39.01 
 
 
391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  38.46 
 
 
391 aa  288  9e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  40.31 
 
 
394 aa  288  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  39.73 
 
 
379 aa  285  7e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  39.36 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  39.36 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  40.22 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  40.52 
 
 
375 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  36.93 
 
 
394 aa  280  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  40.72 
 
 
375 aa  278  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  39.22 
 
 
387 aa  277  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  40.45 
 
 
379 aa  276  6e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  38.83 
 
 
380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  37.08 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  39.05 
 
 
375 aa  273  3e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  40.27 
 
 
397 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  41.99 
 
 
392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  40.27 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  39.26 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  38.67 
 
 
367 aa  272  9e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  39.43 
 
 
380 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  39.12 
 
 
375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  40.92 
 
 
373 aa  269  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  39.57 
 
 
402 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  40.34 
 
 
387 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>