More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1677 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2610  aminotransferase class I and II  85.31 
 
 		 393 aa  662    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.436935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 392 aa  790    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  83.59 
 
 		 393 aa  666    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  86.73 
 
 		 393 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  83.33 
 
 		 393 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4903  aminotransferase class I and II  94.39 
 
 		 392 aa  752    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234248  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  77.98 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2719  aminotransferase  76.15 
 
 		 392 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  55.12 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  50.27 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  45 
 
 		 387 aa  345  5e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  47.48 
 
 		 399 aa  345  7e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  40 
 
 		 398 aa  278  9e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  42.97 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  39.18 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  39.18 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  37.11 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  37.64 
 
 		 387 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  39.05 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  38.58 
 
 		 401 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  41.21 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  38.68 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  37.47 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  37.37 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  40.81 
 
 		 400 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  39.55 
 
 		 370 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  38.12 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  36.9 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  38.04 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  40.7 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  36.41 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  36.88 
 
 		 392 aa  259  4e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  39.94 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  38.85 
 
 		 405 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  38.16 
 
 		 399 aa  259  8e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  37.85 
 
 		 398 aa  258  9e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  37.15 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  39.26 
 
 		 379 aa  257  3e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  38.38 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  36.61 
 
 		 392 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  35.77 
 
 		 392 aa  255  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  36.93 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  37.7 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  34.61 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  40.31 
 
 		 402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  36.34 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  36.13 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  37.47 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  41.53 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  37.63 
 
 		 407 aa  253  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  36.34 
 
 		 400 aa  253  6e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  38.4 
 
 		 392 aa  252  7e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  36.18 
 
 		 400 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  34.61 
 
 		 397 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  39.08 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  37.08 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  38.36 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  39.48 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  37.18 
 
 		 409 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  40.46 
 
 		 414 aa  250  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  38.19 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  39.4 
 
 		 415 aa  250  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  38.44 
 
 		 393 aa  249  4e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  39.63 
 
 		 396 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  36.68 
 
 		 400 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  35.33 
 
 		 396 aa  249  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  35.43 
 
 		 387 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  38.82 
 
 		 406 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  35.43 
 
 		 400 aa  249  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  35.09 
 
 		 400 aa  249  7e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  38.35 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  36.9 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  35.46 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  40.1 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  38.67 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  37.74 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  35.77 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  38.92 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  36.99 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  35.2 
 
 		 375 aa  247  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  36.51 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  35.68 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  41.4 
 
 		 413 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  36.46 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  42.18 
 
 		 373 aa  247  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  36.32 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  34.73 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  36.34 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  35.43 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  39.95 
 
 		 412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  35.54 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  40.27 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  35.18 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  36.09 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  36.57 
 
 		 407 aa  245  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  35.87 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  40.15 
 
 		 411 aa  243  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  37.84 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  35.99 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  36.09 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>