More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2610 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  85.31 
 
 
392 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  90.05 
 
 
393 aa  724    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2610  aminotransferase class I and II  100 
 
 
393 aa  792    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.436935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  88.27 
 
 
393 aa  696    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4903  aminotransferase class I and II  86.53 
 
 
392 aa  683    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234248  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  90.56 
 
 
393 aa  725    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  76.02 
 
 
395 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2719  aminotransferase  73.71 
 
 
392 aa  559  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  55.78 
 
 
393 aa  398  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  51.72 
 
 
392 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  49.1 
 
 
399 aa  360  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  45.03 
 
 
387 aa  353  4e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  43.41 
 
 
387 aa  286  5e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  39.95 
 
 
399 aa  279  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  37.19 
 
 
395 aa  277  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  38.1 
 
 
400 aa  276  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  40.41 
 
 
384 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  37.6 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  39.69 
 
 
401 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  37.29 
 
 
387 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  37.82 
 
 
392 aa  270  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  38.4 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  41.13 
 
 
405 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  39.44 
 
 
399 aa  269  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  39.51 
 
 
390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  39.13 
 
 
398 aa  268  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  39.79 
 
 
397 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  39.31 
 
 
380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  36.22 
 
 
398 aa  266  4e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  37.59 
 
 
398 aa  266  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  41.56 
 
 
411 aa  266  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  38.38 
 
 
400 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  36.18 
 
 
390 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  36.64 
 
 
392 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  38.54 
 
 
379 aa  263  4e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  38.79 
 
 
398 aa  262  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  39.89 
 
 
397 aa  262  6.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  37.63 
 
 
400 aa  262  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  42.86 
 
 
367 aa  262  8e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  40.66 
 
 
400 aa  262  8e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  38.48 
 
 
398 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  38.04 
 
 
397 aa  262  8.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  36.36 
 
 
392 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  36.57 
 
 
392 aa  261  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  38.15 
 
 
398 aa  261  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  37.87 
 
 
398 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  39.55 
 
 
406 aa  260  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  36.13 
 
 
386 aa  260  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  40.15 
 
 
414 aa  259  7e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  39.48 
 
 
398 aa  258  9e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  42.07 
 
 
412 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  41.19 
 
 
381 aa  258  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  34.86 
 
 
394 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  39.14 
 
 
396 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  39.39 
 
 
429 aa  257  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  38.98 
 
 
392 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  36.46 
 
 
393 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  36.59 
 
 
400 aa  256  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  34.79 
 
 
387 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  39.01 
 
 
402 aa  256  6e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  37.66 
 
 
395 aa  256  6e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  34.96 
 
 
397 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  38.07 
 
 
393 aa  256  6e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  38.29 
 
 
391 aa  256  6e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  39.78 
 
 
370 aa  256  7e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  39.45 
 
 
402 aa  255  8e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  38.04 
 
 
400 aa  255  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  39.45 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  37.09 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  36.99 
 
 
397 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  37.06 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0877  aminotransferase  37.1 
 
 
417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.706864  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  36.78 
 
 
398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  37.18 
 
 
409 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  36.59 
 
 
400 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  37.73 
 
 
380 aa  253  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  37.06 
 
 
400 aa  252  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  38.76 
 
 
393 aa  252  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  41.64 
 
 
387 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  37.03 
 
 
400 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  37.12 
 
 
399 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  37.53 
 
 
400 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  40.6 
 
 
415 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  36.82 
 
 
400 aa  250  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  37.34 
 
 
400 aa  249  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 
397 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  41.96 
 
 
413 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  36.57 
 
 
400 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  37.76 
 
 
394 aa  249  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  35.54 
 
 
395 aa  249  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  36.59 
 
 
400 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  34.74 
 
 
395 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  34.74 
 
 
395 aa  249  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  34.74 
 
 
395 aa  249  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  34.74 
 
 
395 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  34.74 
 
 
395 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  33.67 
 
 
395 aa  248  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  38.71 
 
 
379 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  39.6 
 
 
402 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  34.74 
 
 
395 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>