More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4403 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 405 aa  834    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  83.21 
 
 		 404 aa  694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  59.8 
 
 		 403 aa  503  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  58.52 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  53.15 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  53.96 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  53.03 
 
 		 402 aa  441  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  52.24 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  52.03 
 
 		 399 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  48.16 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  46.94 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  47.77 
 
 		 400 aa  361  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  47 
 
 		 400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  47.1 
 
 		 399 aa  353  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  46.15 
 
 		 400 aa  352  5.9999999999999994e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  47.96 
 
 		 398 aa  352  8.999999999999999e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  46.17 
 
 		 402 aa  351  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  46.27 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  45.11 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  46.85 
 
 		 399 aa  349  6e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  46.4 
 
 		 400 aa  349  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  46.67 
 
 		 402 aa  348  7e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  46.67 
 
 		 402 aa  348  8e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  44.91 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  46.15 
 
 		 400 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  45.04 
 
 		 402 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  44.87 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  46.46 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  47.78 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  45.41 
 
 		 400 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  44.95 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  44.91 
 
 		 400 aa  342  5e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  44.67 
 
 		 400 aa  342  7e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  45.16 
 
 		 400 aa  342  7e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  46.12 
 
 		 400 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  46.12 
 
 		 400 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  44.91 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  43.51 
 
 		 400 aa  339  4e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  47.44 
 
 		 396 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  42.07 
 
 		 399 aa  339  4e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  44.25 
 
 		 400 aa  338  9e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  44.42 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  45.29 
 
 		 392 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  45.11 
 
 		 400 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  44.67 
 
 		 400 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  44.47 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  44.3 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  43.54 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  46.79 
 
 		 393 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  44.42 
 
 		 401 aa  332  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  44.17 
 
 		 400 aa  332  6e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  45.71 
 
 		 396 aa  332  7.000000000000001e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  45.96 
 
 		 397 aa  332  7.000000000000001e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  44.61 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  44.22 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  43.92 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  42.42 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  42.75 
 
 		 400 aa  330  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  45.25 
 
 		 401 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2245  aminotransferase class I and II  44.3 
 
 		 397 aa  328  7e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154581  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  43.73 
 
 		 394 aa  328  8e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  44.33 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  43.96 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  44.56 
 
 		 378 aa  327  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  44.7 
 
 		 393 aa  327  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  48.01 
 
 		 400 aa  326  5e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  43.75 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  44.53 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  45.36 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  45.1 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  44.86 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  43.56 
 
 		 400 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  46.6 
 
 		 401 aa  323  4e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  43.11 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  44.86 
 
 		 389 aa  322  5e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  42.5 
 
 		 452 aa  322  6e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  44.25 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1189  aspartate aminotransferase, putative  46.48 
 
 		 384 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.415311 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  44.07 
 
 		 395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  43.08 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  44.07 
 
 		 395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  41.65 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 		 395 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  45.92 
 
 		 400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  42 
 
 		 400 aa  319  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  42.53 
 
 		 389 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  41.98 
 
 		 399 aa  318  9e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  42.78 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  41.41 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  42.64 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  43.88 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  43.25 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  44.25 
 
 		 400 aa  316  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  41.85 
 
 		 400 aa  316  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  43.81 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>