More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2569 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 397 aa  816    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  59.39 
 
 		 399 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  58.82 
 
 		 396 aa  480  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  57.91 
 
 		 396 aa  471  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  57.07 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  55.47 
 
 		 403 aa  463  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  57.07 
 
 		 404 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  53.15 
 
 		 405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  51.77 
 
 		 402 aa  433  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  47.31 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  47.5 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  46.94 
 
 		 402 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  45.55 
 
 		 399 aa  362  8e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  47.07 
 
 		 400 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  46.75 
 
 		 400 aa  359  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  46.5 
 
 		 400 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  46.82 
 
 		 400 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  46.19 
 
 		 402 aa  353  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  46.25 
 
 		 400 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  46.25 
 
 		 400 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  46.94 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  45.18 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  45.8 
 
 		 402 aa  352  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  45.5 
 
 		 400 aa  352  8e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  45.25 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  46.08 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  45.41 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  44.5 
 
 		 400 aa  345  6e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  44.25 
 
 		 400 aa  344  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  45.8 
 
 		 400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  46.84 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  45.29 
 
 		 400 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  46.97 
 
 		 378 aa  342  7e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  44.05 
 
 		 397 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  43.8 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  43.77 
 
 		 395 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  43.75 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 		 399 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  44.05 
 
 		 397 aa  335  7e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  44.11 
 
 		 400 aa  335  9e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  43.36 
 
 		 400 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  44.81 
 
 		 397 aa  334  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  45.25 
 
 		 398 aa  333  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  44.25 
 
 		 400 aa  333  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  43.91 
 
 		 400 aa  332  5e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  40.91 
 
 		 399 aa  332  9e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  42.13 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  42.11 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  43.69 
 
 		 399 aa  331  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  41.4 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  45.15 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  44.27 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1189  aspartate aminotransferase, putative  45.57 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.415311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  42.75 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  42.75 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  41.52 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  42.24 
 
 		 400 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  44.53 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  43.77 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  43.58 
 
 		 403 aa  325  7e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  44.7 
 
 		 397 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  41.12 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  41.12 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  44.5 
 
 		 394 aa  324  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  44.78 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  39.54 
 
 		 390 aa  323  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  43.81 
 
 		 392 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  41.94 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  42.24 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  41.52 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  40.91 
 
 		 410 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  43.81 
 
 		 392 aa  322  6e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  45.8 
 
 		 389 aa  322  6e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  40 
 
 		 399 aa  322  6e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  43.51 
 
 		 400 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  40.61 
 
 		 400 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  42.93 
 
 		 390 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  42.78 
 
 		 397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  41.12 
 
 		 400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  42.07 
 
 		 402 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  42.07 
 
 		 404 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  42.86 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  42.25 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  42.07 
 
 		 402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 		 400 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  40.46 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  42.89 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  43 
 
 		 401 aa  317  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  40.8 
 
 		 406 aa  316  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 		 389 aa  316  6e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  42.78 
 
 		 395 aa  315  7e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  45.59 
 
 		 406 aa  315  8e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  42.53 
 
 		 396 aa  315  9e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  42.5 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  44.42 
 
 		 392 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  43.47 
 
 		 402 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  41.71 
 
 		 402 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  43.32 
 
 		 408 aa  315  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  42.46 
 
 		 397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>