More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0784 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  100 
 
 		 403 aa  820    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  63.37 
 
 		 404 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  59.8 
 
 		 405 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  55.47 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  53.06 
 
 		 396 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  51 
 
 		 399 aa  433  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  53.3 
 
 		 402 aa  432  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  50.64 
 
 		 399 aa  421  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  49.36 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  45.2 
 
 		 402 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  42.71 
 
 		 399 aa  346  4e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  44.16 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  44.55 
 
 		 452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  43.43 
 
 		 397 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  43.07 
 
 		 396 aa  335  7e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  42.78 
 
 		 397 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  43.29 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 		 402 aa  333  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  43.29 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  44.04 
 
 		 395 aa  332  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  42.54 
 
 		 402 aa  331  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  43.37 
 
 		 402 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  41.41 
 
 		 399 aa  328  7e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  41.62 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  42.32 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  41.06 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  43.94 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  43.29 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  42.17 
 
 		 397 aa  322  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 		 423 aa  321  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  45.73 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  42.86 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 		 400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  40.1 
 
 		 399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  41.31 
 
 		 400 aa  319  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  40.4 
 
 		 400 aa  319  6e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  40.81 
 
 		 399 aa  318  7e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  40.81 
 
 		 400 aa  319  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  39.85 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  41.9 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  40.81 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  40.81 
 
 		 400 aa  316  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  38.42 
 
 		 405 aa  316  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  40.3 
 
 		 400 aa  316  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  42.01 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  40.1 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  39.85 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  43.15 
 
 		 395 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1189  aspartate aminotransferase, putative  42.19 
 
 		 384 aa  312  5.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.415311 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  41.27 
 
 		 400 aa  312  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  41.1 
 
 		 400 aa  312  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  39.6 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  41.13 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  42.42 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  40.4 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  40.4 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  39.29 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  40.4 
 
 		 401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  38.69 
 
 		 400 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  42.78 
 
 		 397 aa  310  4e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  40.2 
 
 		 404 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  41.25 
 
 		 401 aa  309  5.9999999999999995e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  42.97 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  40.75 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  41.33 
 
 		 394 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  39.65 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  43.34 
 
 		 389 aa  306  3e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  43.43 
 
 		 397 aa  306  3e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  44.08 
 
 		 397 aa  306  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  39.19 
 
 		 400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  40.98 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  38.85 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  39.8 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  40.27 
 
 		 404 aa  305  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  43.34 
 
 		 389 aa  306  6e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  38.56 
 
 		 402 aa  305  6e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  39.14 
 
 		 397 aa  306  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  37.03 
 
 		 406 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  39.25 
 
 		 400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  39.24 
 
 		 395 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  38.4 
 
 		 393 aa  302  7.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  40.2 
 
 		 400 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  39.04 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  40.36 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07471  aminotransferases class-I  40.2 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.503554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  40.36 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  40.36 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  39.95 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  37.03 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  40.36 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  36.79 
 
 		 414 aa  301  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  37.91 
 
 		 410 aa  300  4e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  40.4 
 
 		 393 aa  299  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  39.69 
 
 		 395 aa  299  7e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  37.37 
 
 		 415 aa  298  9e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  40.1 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>