More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3724 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  83.21 
 
 		 405 aa  711    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 404 aa  826    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  63.37 
 
 		 403 aa  526  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  57.07 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  58.88 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  53.42 
 
 		 402 aa  450  1e-125  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  53.45 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  52.51 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  51.02 
 
 		 399 aa  423  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  47.12 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  48.73 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  47.47 
 
 		 402 aa  363  4e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  46.23 
 
 		 402 aa  360  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  47.1 
 
 		 400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  46.73 
 
 		 400 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  45.84 
 
 		 400 aa  352  8.999999999999999e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  46.08 
 
 		 398 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  45.66 
 
 		 402 aa  349  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  45.15 
 
 		 402 aa  349  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  46.65 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  46.23 
 
 		 399 aa  345  6e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  46.39 
 
 		 423 aa  345  6e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  45.34 
 
 		 400 aa  345  8e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  46.82 
 
 		 398 aa  345  8.999999999999999e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  45.09 
 
 		 400 aa  344  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  45.2 
 
 		 400 aa  344  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  45.84 
 
 		 400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  44.95 
 
 		 400 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  45.48 
 
 		 399 aa  342  8e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  44.97 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  44.97 
 
 		 400 aa  339  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  46.08 
 
 		 398 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  45.45 
 
 		 400 aa  338  8e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  45.45 
 
 		 400 aa  338  8e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  44.72 
 
 		 400 aa  338  8e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  42.68 
 
 		 399 aa  338  9e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  45.2 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  45.59 
 
 		 400 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  45.34 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  43.18 
 
 		 400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  45.09 
 
 		 400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  45.59 
 
 		 400 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  44.55 
 
 		 452 aa  334  1e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  45.22 
 
 		 395 aa  333  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  44.58 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  44.08 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  44.58 
 
 		 400 aa  332  6e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  45.83 
 
 		 395 aa  332  8e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  45.48 
 
 		 389 aa  331  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  44.3 
 
 		 378 aa  330  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  45.11 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  44 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  45.78 
 
 		 396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  43.96 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  44.47 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  44.33 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  44.22 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  44.22 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  43.96 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  43.7 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  45.9 
 
 		 393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  44.84 
 
 		 401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  43.91 
 
 		 392 aa  325  6e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  43.96 
 
 		 395 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  43.96 
 
 		 395 aa  325  7e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  43.96 
 
 		 395 aa  325  7e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  43.96 
 
 		 395 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  43.96 
 
 		 395 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  44.33 
 
 		 397 aa  325  7e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  45.61 
 
 		 389 aa  325  8.000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  43.32 
 
 		 404 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  43.08 
 
 		 392 aa  325  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  42.22 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  44.58 
 
 		 400 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  45.11 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 		 400 aa  323  4e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  42.17 
 
 		 397 aa  323  4e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  43.99 
 
 		 397 aa  323  4e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  43.07 
 
 		 400 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  43.19 
 
 		 395 aa  322  6e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  43.83 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  43.62 
 
 		 390 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  44.84 
 
 		 401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  42.61 
 
 		 400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  42.32 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  44.86 
 
 		 389 aa  320  3.9999999999999996e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1189  aspartate aminotransferase, putative  44.91 
 
 		 384 aa  319  7e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.415311 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  43.08 
 
 		 392 aa  318  7e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 		 397 aa  318  7.999999999999999e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  43.59 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  42.82 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  42.82 
 
 		 393 aa  318  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  42.09 
 
 		 396 aa  318  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  40.97 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 		 397 aa  316  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  46.35 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  42.68 
 
 		 387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  43.3 
 
 		 392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  43.97 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  42.17 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>