More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2245 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2245  aminotransferase class I and II  100 
 
 
397 aa  818    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154581  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  63.52 
 
 
390 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  61.94 
 
 
390 aa  498  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  59.79 
 
 
390 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  57.51 
 
 
393 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0079  aminotransferase class I and II  52.3 
 
 
392 aa  432  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  46.53 
 
 
402 aa  355  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  44.82 
 
 
395 aa  352  8e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  47.01 
 
 
400 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  47.01 
 
 
400 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  45.15 
 
 
389 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  46.75 
 
 
400 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  43.97 
 
 
398 aa  345  7e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  45.96 
 
 
396 aa  343  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  43.67 
 
 
390 aa  344  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  43 
 
 
397 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  45.29 
 
 
392 aa  333  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  45.97 
 
 
400 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  44.47 
 
 
388 aa  332  6e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  42.49 
 
 
397 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  44.3 
 
 
405 aa  328  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  41.78 
 
 
387 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  44.94 
 
 
400 aa  325  9e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  41.79 
 
 
399 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  44.47 
 
 
388 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  44.47 
 
 
388 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  44.76 
 
 
399 aa  323  3e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  42.49 
 
 
397 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  42.97 
 
 
398 aa  322  8e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  45.48 
 
 
398 aa  322  9.000000000000001e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  44.41 
 
 
397 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  41.45 
 
 
401 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  43.11 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  43.62 
 
 
393 aa  319  7e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  42.93 
 
 
397 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  44.68 
 
 
400 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  43.58 
 
 
402 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  45.01 
 
 
401 aa  318  1e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  43.47 
 
 
398 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  44.2 
 
 
388 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  43.34 
 
 
396 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  42.71 
 
 
399 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  41.75 
 
 
406 aa  316  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  42.13 
 
 
395 aa  316  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  41.71 
 
 
405 aa  316  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  44.65 
 
 
400 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  41.87 
 
 
399 aa  315  7e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  41.62 
 
 
394 aa  315  8e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  44.82 
 
 
404 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  42.97 
 
 
414 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  44.76 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  44.68 
 
 
400 aa  314  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  41.62 
 
 
387 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  45.07 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  43.34 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  40.35 
 
 
399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  40.4 
 
 
397 aa  312  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  44.33 
 
 
400 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  43.11 
 
 
410 aa  312  7.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  43.01 
 
 
400 aa  312  7.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  43.64 
 
 
400 aa  311  9e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  43.8 
 
 
460 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  42.38 
 
 
400 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  43 
 
 
397 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  43.01 
 
 
400 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  42.75 
 
 
400 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  44.25 
 
 
402 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  41.21 
 
 
389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  42.64 
 
 
400 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  44.08 
 
 
402 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  40.97 
 
 
393 aa  308  9e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  40.46 
 
 
396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  42.38 
 
 
409 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  40.81 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  44.44 
 
 
378 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  41.8 
 
 
392 aa  305  7e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  43.41 
 
 
400 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  43.41 
 
 
400 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  43.73 
 
 
402 aa  305  7e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  42.38 
 
 
400 aa  305  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  41.75 
 
 
400 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  41.3 
 
 
398 aa  305  9.000000000000001e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  41.71 
 
 
411 aa  305  9.000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  41.71 
 
 
395 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  39.32 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  39.32 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  45.19 
 
 
391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  41.53 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  39.29 
 
 
397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  40 
 
 
398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  40.21 
 
 
395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  40.42 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  42.86 
 
 
400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  43.81 
 
 
401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  42.19 
 
 
393 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  42.12 
 
 
400 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  43.85 
 
 
404 aa  302  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  41.42 
 
 
392 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  39.43 
 
 
395 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  40.58 
 
 
389 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>