More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0079 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0079  aminotransferase class I and II  100 
 
 
392 aa  803    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  60.71 
 
 
393 aa  508  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  59.64 
 
 
390 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  60.41 
 
 
390 aa  488  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  57.58 
 
 
390 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2245  aminotransferase class I and II  52.3 
 
 
397 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154581  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  45.2 
 
 
401 aa  352  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  44.64 
 
 
389 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  42.17 
 
 
397 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  44.13 
 
 
400 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  42.61 
 
 
397 aa  338  9e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  42.31 
 
 
388 aa  333  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  41.07 
 
 
387 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  41.96 
 
 
399 aa  330  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  42.75 
 
 
398 aa  330  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  41.81 
 
 
398 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  42.42 
 
 
397 aa  330  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  40.91 
 
 
397 aa  330  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  40.66 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  42.93 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  44.19 
 
 
400 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  42.71 
 
 
393 aa  325  6e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  43.69 
 
 
397 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  42.71 
 
 
388 aa  325  9e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  43.43 
 
 
395 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  42.35 
 
 
388 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  42.93 
 
 
413 aa  321  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  41.21 
 
 
399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  41.9 
 
 
400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  42.35 
 
 
388 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  42.34 
 
 
400 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  43.54 
 
 
460 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  42.34 
 
 
400 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  42.86 
 
 
392 aa  320  3e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  40.86 
 
 
390 aa  319  5e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  41.28 
 
 
395 aa  319  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  41.28 
 
 
395 aa  319  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  41.28 
 
 
395 aa  319  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  41.28 
 
 
395 aa  319  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  41.28 
 
 
395 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  43.69 
 
 
396 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  42.09 
 
 
395 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  41.28 
 
 
395 aa  317  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  41.03 
 
 
395 aa  316  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  42.09 
 
 
395 aa  316  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  41.13 
 
 
400 aa  316  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  39.95 
 
 
395 aa  315  7e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  41.03 
 
 
395 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  42.17 
 
 
401 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  42.68 
 
 
400 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  40.25 
 
 
411 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  38.42 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  42.42 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  41.94 
 
 
400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  41.41 
 
 
400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  38.42 
 
 
397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  40.92 
 
 
396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  41.16 
 
 
400 aa  312  5.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  40.4 
 
 
400 aa  311  9e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  41.92 
 
 
400 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 
400 aa  311  9e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  40 
 
 
395 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  41.52 
 
 
410 aa  311  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  40.56 
 
 
392 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  40.51 
 
 
400 aa  311  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  40.56 
 
 
392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  42.17 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  39.49 
 
 
405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  42.42 
 
 
400 aa  310  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  43.43 
 
 
399 aa  310  4e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  41.77 
 
 
402 aa  309  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  42.74 
 
 
392 aa  309  5.9999999999999995e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  43.88 
 
 
404 aa  308  9e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  41.37 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  41.27 
 
 
415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  41.18 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  41.56 
 
 
414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  41.65 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  42.56 
 
 
402 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  40.66 
 
 
400 aa  306  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  42.25 
 
 
400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  42.56 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  41.27 
 
 
393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  41.65 
 
 
400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  42.71 
 
 
404 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  41.41 
 
 
400 aa  306  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  39.74 
 
 
394 aa  305  7e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  40.97 
 
 
401 aa  305  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  39.49 
 
 
406 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  42.6 
 
 
402 aa  305  9.000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  41.69 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  37.5 
 
 
397 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  40 
 
 
402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  41.67 
 
 
400 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  40 
 
 
411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  41.03 
 
 
400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  43.11 
 
 
402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  38.62 
 
 
389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  41.13 
 
 
392 aa  302  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 
396 aa  302  6.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>