More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0003 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  100 
 
 
388 aa  803    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  73.56 
 
 
385 aa  590  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  65.89 
 
 
387 aa  533  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  64.57 
 
 
400 aa  529  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  65.54 
 
 
386 aa  526  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  57.74 
 
 
396 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  55.29 
 
 
391 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  54.33 
 
 
390 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  53.89 
 
 
397 aa  443  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  54.97 
 
 
399 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  52.22 
 
 
396 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  51.44 
 
 
396 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  55.5 
 
 
390 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  51.96 
 
 
396 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  51.96 
 
 
396 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  51.96 
 
 
396 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  51.96 
 
 
396 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  52.91 
 
 
393 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  51.96 
 
 
396 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  51.7 
 
 
396 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  51.96 
 
 
396 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  51.17 
 
 
396 aa  425  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  51.17 
 
 
387 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  52.48 
 
 
407 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  50.66 
 
 
387 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  50.91 
 
 
396 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  50.79 
 
 
392 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  50.52 
 
 
392 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  52.86 
 
 
393 aa  418  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  52.94 
 
 
401 aa  415  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  52.36 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  51.8 
 
 
404 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  51.99 
 
 
388 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  49.74 
 
 
390 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  49.74 
 
 
405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  49.61 
 
 
395 aa  399  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  47.78 
 
 
398 aa  390  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  47.52 
 
 
398 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  48.03 
 
 
386 aa  388  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  47.52 
 
 
398 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 
410 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  50.39 
 
 
385 aa  390  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  47.93 
 
 
386 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  50 
 
 
381 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  48.54 
 
 
402 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  50.39 
 
 
385 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 
383 aa  381  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  51.19 
 
 
380 aa  378  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  49.34 
 
 
386 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  48.29 
 
 
387 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  47.88 
 
 
381 aa  365  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  49.48 
 
 
388 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  50 
 
 
393 aa  368  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  45.83 
 
 
388 aa  363  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  39.95 
 
 
387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  39.95 
 
 
387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  39.95 
 
 
387 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  39.18 
 
 
387 aa  307  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  39.69 
 
 
387 aa  305  7e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  40.05 
 
 
385 aa  305  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  39.69 
 
 
387 aa  305  7e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  39.18 
 
 
387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  39.43 
 
 
387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  38.92 
 
 
387 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  45.33 
 
 
367 aa  301  9e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  39.01 
 
 
387 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  40.86 
 
 
370 aa  294  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  41.81 
 
 
375 aa  290  3e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  39.84 
 
 
399 aa  288  1e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  41.43 
 
 
379 aa  286  4e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  36.81 
 
 
384 aa  280  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  36.81 
 
 
384 aa  280  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  38.86 
 
 
380 aa  279  6e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  39.58 
 
 
387 aa  278  9e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  39.33 
 
 
394 aa  277  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  36.68 
 
 
380 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  36.77 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  42.11 
 
 
370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  35.39 
 
 
380 aa  272  6e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  37.43 
 
 
401 aa  272  6e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  34.97 
 
 
394 aa  271  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  37.14 
 
 
380 aa  268  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  38.16 
 
 
385 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  40.74 
 
 
371 aa  268  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  37.73 
 
 
385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 
386 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  41.46 
 
 
400 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  41.8 
 
 
400 aa  263  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  35.49 
 
 
382 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  38.13 
 
 
396 aa  263  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  38.56 
 
 
401 aa  263  4.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  37.8 
 
 
375 aa  262  8e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1200  aminotransferase  36.1 
 
 
393 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.241319  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  37.66 
 
 
392 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  39.49 
 
 
400 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  38.57 
 
 
397 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  38.84 
 
 
397 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  36.39 
 
 
387 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  38.93 
 
 
367 aa  260  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0044  aromatic amino acid aminotransferase  37.11 
 
 
395 aa  259  4e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>