More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1173 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  92.6 
 
 
392 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  100 
 
 
392 aa  791    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  50.91 
 
 
396 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  50.65 
 
 
395 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  51.96 
 
 
393 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  51.44 
 
 
393 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  49.35 
 
 
396 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  52.34 
 
 
396 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  49.61 
 
 
396 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  46.25 
 
 
409 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0178  aminotransferase class I and II  38.96 
 
 
396 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  37.44 
 
 
395 aa  278  8e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  38.71 
 
 
397 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4172  aminotransferase  37.5 
 
 
389 aa  246  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000308334  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  34.68 
 
 
389 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  32.74 
 
 
392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  35.7 
 
 
386 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  34.34 
 
 
388 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  37.6 
 
 
396 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  35.96 
 
 
390 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  37.19 
 
 
391 aa  238  2e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  36.74 
 
 
393 aa  237  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  33.6 
 
 
399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  37.98 
 
 
410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  34.62 
 
 
380 aa  236  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  36.16 
 
 
387 aa  236  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  36.54 
 
 
400 aa  235  9e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  37.05 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  35 
 
 
387 aa  233  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  38.92 
 
 
389 aa  232  7.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  38.29 
 
 
405 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  35.23 
 
 
379 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  34.73 
 
 
386 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  34.73 
 
 
402 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  37.29 
 
 
387 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  34.07 
 
 
400 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  32.8 
 
 
392 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  34.75 
 
 
388 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  34.3 
 
 
400 aa  230  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  34.3 
 
 
400 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1956  aminotransferase  34.97 
 
 
398 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.476214  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  32.19 
 
 
380 aa  229  6e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  30.33 
 
 
387 aa  229  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  37.12 
 
 
395 aa  229  8e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  32 
 
 
375 aa  229  9e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  34.78 
 
 
392 aa  228  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  35.65 
 
 
404 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  35.26 
 
 
390 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  32.51 
 
 
407 aa  227  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  33.51 
 
 
388 aa  227  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  34.3 
 
 
400 aa  227  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  34.11 
 
 
394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  35.16 
 
 
414 aa  226  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  35.7 
 
 
400 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  35.85 
 
 
389 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  35.81 
 
 
386 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  34.62 
 
 
397 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  33.51 
 
 
398 aa  224  3e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  37.4 
 
 
388 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  34.59 
 
 
400 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  32.58 
 
 
400 aa  222  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  34.59 
 
 
400 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  37.09 
 
 
387 aa  222  8e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 
398 aa  222  9e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  30.97 
 
 
395 aa  222  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  36.46 
 
 
400 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  38.78 
 
 
386 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  30.97 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  30.97 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  30.97 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  30.97 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  30.97 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  31.06 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  32.08 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 
401 aa  220  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  34.27 
 
 
388 aa  221  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  33.71 
 
 
392 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  34.93 
 
 
406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  35.54 
 
 
402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  33.77 
 
 
400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  30.59 
 
 
385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  32.98 
 
 
389 aa  219  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  32.7 
 
 
398 aa  219  6e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  30.97 
 
 
395 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  33.43 
 
 
387 aa  219  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  37.16 
 
 
444 aa  219  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  30.97 
 
 
395 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  32.87 
 
 
388 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  36.8 
 
 
383 aa  219  7e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  32.7 
 
 
397 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  33.43 
 
 
392 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  32.87 
 
 
388 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  34.64 
 
 
385 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  30.45 
 
 
395 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  33.15 
 
 
387 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  40.39 
 
 
404 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  35.29 
 
 
402 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  33.58 
 
 
400 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  34.29 
 
 
400 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>