More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5709 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  81.44 
 
 
396 aa  634    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  100 
 
 
393 aa  789    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  96.18 
 
 
393 aa  759    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  82.22 
 
 
396 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  81.19 
 
 
396 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  72.82 
 
 
395 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  67.35 
 
 
396 aa  522  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  61.99 
 
 
409 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  51.96 
 
 
392 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  51.28 
 
 
392 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  41.67 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  43.83 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0178  aminotransferase class I and II  39.9 
 
 
396 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1956  aminotransferase  40.66 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.476214  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  35.66 
 
 
392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  37.77 
 
 
401 aa  252  6e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  40.17 
 
 
410 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  37.57 
 
 
399 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  39.4 
 
 
444 aa  249  5e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  37.17 
 
 
392 aa  242  9e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  36.78 
 
 
388 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  35.69 
 
 
386 aa  239  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  36.65 
 
 
390 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  35.29 
 
 
407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  36.46 
 
 
388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  31.7 
 
 
387 aa  235  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  36.61 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  35.16 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  38.42 
 
 
405 aa  234  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  35.88 
 
 
400 aa  234  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4172  aminotransferase  37.57 
 
 
389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000308334  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  36.41 
 
 
386 aa  233  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  40.06 
 
 
386 aa  233  6e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  35.67 
 
 
398 aa  233  6e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  35.44 
 
 
404 aa  232  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  36.54 
 
 
393 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  36.57 
 
 
385 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  33.05 
 
 
375 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  38.5 
 
 
396 aa  231  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  35.45 
 
 
379 aa  231  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  38.14 
 
 
387 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  35.71 
 
 
396 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  36.74 
 
 
395 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  33.97 
 
 
380 aa  229  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  35.71 
 
 
396 aa  229  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  35.7 
 
 
383 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  35.73 
 
 
402 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  36.41 
 
 
393 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  35.96 
 
 
384 aa  227  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  38.35 
 
 
391 aa  227  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  35.85 
 
 
398 aa  227  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  35.07 
 
 
400 aa  227  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  36.57 
 
 
393 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 
400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  32.73 
 
 
395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  35.03 
 
 
401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  32.73 
 
 
395 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  32.99 
 
 
395 aa  226  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  35.11 
 
 
391 aa  226  7e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  35.62 
 
 
400 aa  226  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  33.99 
 
 
380 aa  225  9e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  36.24 
 
 
390 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  34.79 
 
 
400 aa  225  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  33.61 
 
 
387 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  32.9 
 
 
395 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  32.9 
 
 
395 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  32.9 
 
 
395 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  35.6 
 
 
393 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  34.27 
 
 
398 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  36.75 
 
 
400 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  32.9 
 
 
395 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  32.9 
 
 
395 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  36.75 
 
 
400 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  32.73 
 
 
395 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  35.89 
 
 
400 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  36.03 
 
 
400 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  32.73 
 
 
395 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2719  aminotransferase  36.31 
 
 
392 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  32.06 
 
 
397 aa  223  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  34.34 
 
 
388 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  35.08 
 
 
388 aa  223  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  35.14 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  35.05 
 
 
392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  31.61 
 
 
395 aa  223  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  36.04 
 
 
395 aa  223  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  37.47 
 
 
376 aa  223  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  37.29 
 
 
391 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  35.43 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  36.5 
 
 
400 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  33.97 
 
 
400 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  31.97 
 
 
385 aa  222  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  35.33 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  35.14 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  33.6 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  35.77 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  37.22 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  34.52 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  34.86 
 
 
396 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  34.86 
 
 
396 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  36.59 
 
 
404 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>