More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0178 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0178  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 396 aa  807    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  56.44 
 
 		 395 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  39.64 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  39.29 
 
 		 409 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  39.9 
 
 		 393 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  38.08 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  39.64 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  38.08 
 
 		 396 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  37.91 
 
 		 395 aa  285  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  38.38 
 
 		 396 aa  282  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  38.96 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  38.7 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1956  aminotransferase  39.43 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.476214  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  34.59 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  32.7 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  32.45 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  33.78 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  28.5 
 
 		 387 aa  206  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  34.04 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  29.73 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  30.48 
 
 		 387 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  33.07 
 
 		 393 aa  199  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  32.74 
 
 		 460 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  34.34 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  30 
 
 		 392 aa  196  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  34.26 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  35.93 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  31.77 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  32.98 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  33.16 
 
 		 400 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  35.01 
 
 		 400 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  30.85 
 
 		 393 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  30.96 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  34.21 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  34.21 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  32.99 
 
 		 402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  33.01 
 
 		 410 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  32.39 
 
 		 400 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  31.66 
 
 		 402 aa  189  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  32.65 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  31.87 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  35.36 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  35.04 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  32.34 
 
 		 411 aa  187  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  30.25 
 
 		 392 aa  186  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  29.97 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  33.6 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  31.94 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  32.49 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  29.81 
 
 		 380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  29.81 
 
 		 388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  29.89 
 
 		 392 aa  183  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  29.77 
 
 		 400 aa  182  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  30.75 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  29.17 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  29.17 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  30.08 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  30.08 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  29.81 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  31.55 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0890  aminotransferase class I and II  31.72 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  31.02 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  31.02 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  31.02 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  31.02 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  31.02 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  31.48 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  31.02 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5769  aminotransferase class I and II  32.52 
 
 		 423 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274836 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  32.01 
 
 		 400 aa  179  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  30.43 
 
 		 392 aa  179  7e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  29.22 
 
 		 401 aa  179  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  30.93 
 
 		 395 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  31.75 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  30.03 
 
 		 386 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.38 
 
 		 404 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  30.08 
 
 		 389 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  31.55 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  30.95 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  31.05 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  31.17 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  28.61 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  32.34 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4903  aminotransferase class I and II  30.52 
 
 		 392 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234248  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  30.73 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  30.58 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  30.67 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  30.54 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  29.52 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  30.67 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  30.99 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  32.69 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  31.32 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  31.99 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  30.67 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  30.37 
 
 		 400 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  30.03 
 
 		 395 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  30.69 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 400 aa  176  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>