More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5434 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 392 aa  790    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  92.6 
 
 		 392 aa  734    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  51.03 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  50.51 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  53.51 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  49.74 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  51.28 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  49.74 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  50.77 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  46.61 
 
 		 409 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0178  aminotransferase class I and II  38.7 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  37.56 
 
 		 395 aa  275  8e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  37.6 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4172  aminotransferase  38.54 
 
 		 389 aa  252  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000308334  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  37.71 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  34.79 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  37.88 
 
 		 396 aa  240  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  34.32 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  36.24 
 
 		 390 aa  236  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  35.14 
 
 		 386 aa  235  8e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  35.37 
 
 		 392 aa  235  8e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  32.3 
 
 		 392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  38.84 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  35.36 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  37.47 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  35.65 
 
 		 387 aa  233  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  36.69 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  33.51 
 
 		 399 aa  233  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  34.34 
 
 		 380 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  36.44 
 
 		 387 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  33.87 
 
 		 392 aa  232  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  39.18 
 
 		 389 aa  232  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  33.7 
 
 		 387 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  38.06 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  35.09 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  35.01 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  35.87 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  35.36 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  36.77 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  36.49 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  30.08 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  36.41 
 
 		 400 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  33.97 
 
 		 388 aa  229  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  32 
 
 		 375 aa  229  8e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  31.93 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  34.83 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  35.1 
 
 		 404 aa  227  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  39.72 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  35.67 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1956  aminotransferase  34.46 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.476214  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  34.82 
 
 		 390 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  36.21 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  33.08 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  35.67 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  34.55 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  33.99 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  32.69 
 
 		 400 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  34.27 
 
 		 392 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  33.06 
 
 		 407 aa  223  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  35.54 
 
 		 402 aa  223  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  35.65 
 
 		 386 aa  222  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  34.55 
 
 		 414 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  35.26 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  33.59 
 
 		 400 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  32.61 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  32.67 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  34.37 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  34.92 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  31.4 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  32.36 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  34.38 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  34.34 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  34.34 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  34.07 
 
 		 397 aa  219  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  33.77 
 
 		 400 aa  219  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  33.68 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  33.86 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  33.43 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  31.13 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  31.4 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  31.13 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  31.13 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  31.25 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  31.13 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  31.13 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  39.55 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  37.4 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  31.5 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  31.4 
 
 		 395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  36.41 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  31.76 
 
 		 397 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  37.16 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  35.23 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  30.08 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  30.41 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2478  aspartate aminotransferase  34.51 
 
 		 377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  35.97 
 
 		 401 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  34.6 
 
 		 400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  32.64 
 
 		 400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>