More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4172 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4172  aminotransferase  100 
 
 		 389 aa  797    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000308334  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  57.58 
 
 		 389 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  39.73 
 
 		 380 aa  282  9e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  38.36 
 
 		 389 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  39.3 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  35.05 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  37.6 
 
 		 386 aa  263  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  36.1 
 
 		 388 aa  259  8e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  37.31 
 
 		 390 aa  255  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  37.84 
 
 		 379 aa  255  8e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  36.46 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  36.88 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  38.06 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  38.54 
 
 		 392 aa  252  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  36.27 
 
 		 400 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  37.32 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  36.87 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  37.78 
 
 		 398 aa  250  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  37.24 
 
 		 393 aa  249  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  35.46 
 
 		 388 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  37.5 
 
 		 392 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  35.46 
 
 		 388 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  39.62 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  37.34 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  37.16 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  33.7 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0421  aspartate aminotransferase  37.53 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.248364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  34.54 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  37.08 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  34.44 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  37.08 
 
 		 398 aa  239  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  39.45 
 
 		 401 aa  239  8e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  38.08 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  34.01 
 
 		 397 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  36.65 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  35.92 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  36.67 
 
 		 395 aa  235  9e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  33 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  33.93 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  34.79 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4903  aminotransferase class I and II  36.9 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234248  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  37.57 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  38.27 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  33.67 
 
 		 394 aa  233  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  36.18 
 
 		 376 aa  233  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  34.92 
 
 		 396 aa  233  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  35.34 
 
 		 399 aa  233  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  37.02 
 
 		 393 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  36.44 
 
 		 392 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  35.53 
 
 		 397 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2478  aspartate aminotransferase  35.57 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  34.83 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  37.22 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  36.29 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  31.59 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  37.33 
 
 		 390 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  34.92 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  34.61 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  35.73 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  34.44 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  33.77 
 
 		 400 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  34.52 
 
 		 395 aa  226  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  36 
 
 		 393 aa  226  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  35.11 
 
 		 407 aa  225  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  36.49 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  36.87 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  35.18 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  31.73 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  32.9 
 
 		 379 aa  224  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  34.09 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  34.62 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  30.95 
 
 		 395 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  30.95 
 
 		 395 aa  223  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  30.95 
 
 		 395 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  30.95 
 
 		 395 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  30.95 
 
 		 395 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  36.21 
 
 		 393 aa  223  7e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  36.86 
 
 		 399 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  31.2 
 
 		 395 aa  222  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  35.75 
 
 		 393 aa  222  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  35.25 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  32.66 
 
 		 395 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  32.41 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  35.1 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  35.1 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  35.1 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  35.8 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  32.08 
 
 		 399 aa  219  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  30.95 
 
 		 395 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  31.49 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  35.28 
 
 		 402 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  30.69 
 
 		 395 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  36.67 
 
 		 393 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  30.43 
 
 		 395 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  33.75 
 
 		 400 aa  219  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  33.25 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3038  aminotransferase class I and II  37.6 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000279526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>