More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1205 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  100 
 
 
397 aa  820    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  60.42 
 
 
404 aa  498  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  59.42 
 
 
405 aa  496  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  62.79 
 
 
388 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  58.73 
 
 
399 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  60.37 
 
 
396 aa  484  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  59.59 
 
 
393 aa  479  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  59.54 
 
 
401 aa  480  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  57.03 
 
 
387 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  58.22 
 
 
390 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  56.05 
 
 
390 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  54.66 
 
 
392 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  55.06 
 
 
387 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  54.66 
 
 
392 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  55.96 
 
 
407 aa  464  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  57.25 
 
 
386 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  55.5 
 
 
402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  56.48 
 
 
390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  53.37 
 
 
398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  53.63 
 
 
398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  53.37 
 
 
398 aa  451  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  54.19 
 
 
400 aa  451  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  54.21 
 
 
391 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  52.99 
 
 
393 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  53.89 
 
 
388 aa  443  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  56.2 
 
 
391 aa  440  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  53.08 
 
 
396 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  53.66 
 
 
385 aa  436  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  53.94 
 
 
395 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  52.05 
 
 
396 aa  428  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  52.05 
 
 
396 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  52.05 
 
 
396 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  52.31 
 
 
396 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  51.79 
 
 
396 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  51.79 
 
 
396 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  51.79 
 
 
396 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  51.79 
 
 
396 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  51.79 
 
 
396 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  52.49 
 
 
388 aa  428  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  51.54 
 
 
396 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  51.64 
 
 
410 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  54.71 
 
 
386 aa  422  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  51.69 
 
 
385 aa  424  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  53.65 
 
 
387 aa  422  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  53.89 
 
 
393 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  51.45 
 
 
386 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  51.97 
 
 
385 aa  410  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  52.24 
 
 
387 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  53 
 
 
386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  52.08 
 
 
388 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  50.66 
 
 
383 aa  392  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  49.21 
 
 
381 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  51.06 
 
 
380 aa  373  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  47.09 
 
 
381 aa  365  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  43.85 
 
 
387 aa  316  6e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  41.45 
 
 
387 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  40.93 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  40.67 
 
 
387 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  40.93 
 
 
387 aa  306  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  41.79 
 
 
385 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  40.93 
 
 
387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  40.93 
 
 
387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  40.93 
 
 
387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  40.1 
 
 
387 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  40.31 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  40.67 
 
 
387 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  40.67 
 
 
387 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  38.5 
 
 
398 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  40.65 
 
 
394 aa  292  6e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  38.6 
 
 
382 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  39.47 
 
 
370 aa  288  9e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  40.9 
 
 
399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  38.28 
 
 
380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  41.9 
 
 
392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  38.28 
 
 
380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  40.36 
 
 
401 aa  282  9e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  38.83 
 
 
391 aa  279  7e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  37.5 
 
 
391 aa  278  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  38.07 
 
 
391 aa  277  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  43.25 
 
 
402 aa  273  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  42.21 
 
 
379 aa  270  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  36.98 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  40 
 
 
367 aa  269  7e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  38.89 
 
 
387 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  41.01 
 
 
387 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  39.16 
 
 
379 aa  267  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  35.16 
 
 
384 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  35.16 
 
 
384 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  38.33 
 
 
380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  40.9 
 
 
388 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  37.56 
 
 
386 aa  266  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  38.22 
 
 
394 aa  265  8.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  41.01 
 
 
370 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  38.34 
 
 
388 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  41.69 
 
 
392 aa  262  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  38.34 
 
 
388 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1200  aminotransferase  36.29 
 
 
393 aa  262  8.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.241319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  39.36 
 
 
397 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  42.19 
 
 
396 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  39.38 
 
 
380 aa  260  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>