More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2185 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  93.94 
 
 		 396 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  94.44 
 
 		 396 aa  765    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 396 aa  803    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  82.22 
 
 		 393 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  82.05 
 
 		 393 aa  648    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  73.66 
 
 		 395 aa  591  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  66.32 
 
 		 396 aa  519  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  63.71 
 
 		 409 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  50.91 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  50.51 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0178  aminotransferase class I and II  39.64 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  40.57 
 
 		 395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  42.28 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1956  aminotransferase  39.85 
 
 		 398 aa  276  5e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.476214  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  38.1 
 
 		 399 aa  263  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  32.65 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  35.75 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  39.94 
 
 		 405 aa  249  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  35.44 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  37 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 		 410 aa  245  8e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  36.77 
 
 		 380 aa  245  8e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  37.12 
 
 		 387 aa  243  6e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  36.91 
 
 		 401 aa  243  6e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  39.34 
 
 		 396 aa  242  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  35.5 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  37.95 
 
 		 387 aa  239  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  36.5 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  34.49 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4172  aminotransferase  36.65 
 
 		 389 aa  237  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000308334  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  36.8 
 
 		 388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  33.15 
 
 		 375 aa  235  8e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  34.77 
 
 		 380 aa  235  9e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  36.09 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  35.45 
 
 		 379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  37.03 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  33.16 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  38.1 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  35 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  38.02 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  33.16 
 
 		 395 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  35.46 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  37.61 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  33.16 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  37.04 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  35.26 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  36.49 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  36.09 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  38.33 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  35.08 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  38.48 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  34.35 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  32.64 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  38.98 
 
 		 391 aa  229  4e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  35 
 
 		 400 aa  230  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  35.79 
 
 		 400 aa  230  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  33.43 
 
 		 387 aa  229  9e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  35.83 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  34.21 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  35.81 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  33.92 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  32.37 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  37.74 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  35.26 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  32.89 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  37.89 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  35.5 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  39.29 
 
 		 386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  35.94 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  35.36 
 
 		 409 aa  226  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  34.62 
 
 		 388 aa  226  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  37.2 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  35.19 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  31.87 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  34.74 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  35.58 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  35.66 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  35.44 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  34.99 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  34.46 
 
 		 398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  37 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  33.06 
 
 		 387 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  35.05 
 
 		 390 aa  223  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  37.02 
 
 		 397 aa  222  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  34.97 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  34.02 
 
 		 393 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  32.43 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  34.47 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  34.47 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  34.47 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2719  aminotransferase  35.77 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  35.23 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>