More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0111 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  100 
 
 		 401 aa  825    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  70.41 
 
 		 444 aa  567  1e-160  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  42.31 
 
 		 410 aa  298  8e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  40.99 
 
 		 386 aa  293  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  40.1 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  40.42 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  39.18 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  39.59 
 
 		 386 aa  285  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  39.29 
 
 		 407 aa  285  9e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  39.03 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  39.95 
 
 		 390 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  39.43 
 
 		 388 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  39.59 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  39.85 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  39.33 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  39.33 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  38.56 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  41.01 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  38.21 
 
 		 395 aa  270  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  38.22 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  38.32 
 
 		 390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  38.74 
 
 		 392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  38.14 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  39.9 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  38.05 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  39.95 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  38.05 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  37.89 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  39.27 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  37.79 
 
 		 396 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  37.79 
 
 		 396 aa  263  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  38.74 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  38.14 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  37.53 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  37.53 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  37.53 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  37.53 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  37.53 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  37.17 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  37.17 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  37.02 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  38.46 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  37.11 
 
 		 396 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  38.15 
 
 		 387 aa  260  4e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  38.81 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  37.02 
 
 		 391 aa  259  8e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  38.05 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  38.54 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  38.48 
 
 		 402 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  36.99 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  37.7 
 
 		 397 aa  256  5e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  38.32 
 
 		 399 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  38.46 
 
 		 375 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  39.45 
 
 		 388 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  37.74 
 
 		 393 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  36.24 
 
 		 398 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  38.8 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  36.99 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  38.11 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  35.59 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  37.5 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  38.08 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  37.44 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  37.36 
 
 		 379 aa  249  5e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  35.09 
 
 		 395 aa  249  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 		 395 aa  249  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  35.34 
 
 		 395 aa  249  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  38.02 
 
 		 392 aa  249  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  37.28 
 
 		 385 aa  249  7e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  35.84 
 
 		 395 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  35.84 
 
 		 395 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  35.84 
 
 		 395 aa  249  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  35.84 
 
 		 395 aa  249  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  35.84 
 
 		 395 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  35.44 
 
 		 412 aa  249  8e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  36.99 
 
 		 396 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  35.59 
 
 		 395 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  38.42 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  36.44 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  39.01 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  35.09 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  38.74 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  36.99 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  35.5 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  36.32 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  37.85 
 
 		 385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  38.59 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  37.63 
 
 		 401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  36.93 
 
 		 390 aa  246  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  37.11 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  38.9 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  36.99 
 
 		 396 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  37.91 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  37.44 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  37.36 
 
 		 388 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  37.04 
 
 		 393 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  37.07 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  36.8 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  35.62 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>