More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3240 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
388 aa  780    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  89.84 
 
 
387 aa  702    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  71.17 
 
 
386 aa  566  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  71.06 
 
 
386 aa  559  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  62.96 
 
 
393 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  56.61 
 
 
399 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  54.86 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  54.86 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  54.59 
 
 
398 aa  437  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  57.44 
 
 
410 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  54.84 
 
 
390 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  54.74 
 
 
391 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  52.77 
 
 
402 aa  421  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  49.87 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  52.76 
 
 
390 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  52.84 
 
 
407 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  53.4 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  53.42 
 
 
405 aa  411  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  51.04 
 
 
396 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  50 
 
 
387 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  52.08 
 
 
397 aa  412  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  50 
 
 
386 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  56.79 
 
 
390 aa  408  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  54.59 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  50 
 
 
392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  49.74 
 
 
392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  53.6 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  52.09 
 
 
404 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  51.43 
 
 
387 aa  402  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  50.26 
 
 
396 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  49.74 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  50 
 
 
396 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  50 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  50 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  50 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  50 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  50.81 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  50 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  50 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  50 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  51.44 
 
 
400 aa  395  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  47.12 
 
 
388 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  51.59 
 
 
393 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  49.22 
 
 
391 aa  388  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  50 
 
 
385 aa  384  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  52.49 
 
 
386 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  49.48 
 
 
388 aa  381  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  48.69 
 
 
385 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  48.28 
 
 
383 aa  365  1e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  48.56 
 
 
385 aa  361  1e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  47.26 
 
 
395 aa  361  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  46.83 
 
 
381 aa  349  4e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  46.17 
 
 
381 aa  348  1e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  47.49 
 
 
380 aa  347  2e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  39.37 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  40.1 
 
 
387 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  42.97 
 
 
400 aa  302  8.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  38.85 
 
 
387 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  39.11 
 
 
387 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  39.01 
 
 
387 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  39.01 
 
 
387 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  39.21 
 
 
387 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  38.85 
 
 
385 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  38.85 
 
 
387 aa  298  8e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  38.85 
 
 
387 aa  298  8e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  38.58 
 
 
387 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  41.38 
 
 
380 aa  295  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  41.09 
 
 
394 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  41.3 
 
 
391 aa  293  3e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  37.4 
 
 
398 aa  293  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  40.37 
 
 
382 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  42.4 
 
 
379 aa  288  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  40.66 
 
 
397 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  45.66 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  43.04 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  40.11 
 
 
397 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  35.48 
 
 
380 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  40.96 
 
 
370 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  38.56 
 
 
401 aa  279  5e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  40.93 
 
 
392 aa  279  5e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  37.85 
 
 
385 aa  279  6e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  35.66 
 
 
380 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  38.73 
 
 
380 aa  278  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  39.84 
 
 
385 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  37.69 
 
 
391 aa  276  3e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  39.01 
 
 
394 aa  277  3e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  37.3 
 
 
375 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  37.89 
 
 
391 aa  275  8e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  36.98 
 
 
375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  41.5 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  43.53 
 
 
402 aa  273  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  38.71 
 
 
395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  37.89 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  39.68 
 
 
379 aa  272  6e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  39 
 
 
389 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  41.82 
 
 
444 aa  272  8.000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  37.4 
 
 
375 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  40.88 
 
 
397 aa  271  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  41.53 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  36.51 
 
 
375 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>