More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3605 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  100 
 
 		 395 aa  803    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0178  aminotransferase class I and II  56.44 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  41.67 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  41.67 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  40.57 
 
 		 396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  39.53 
 
 		 396 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  39.28 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  38.54 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  39.43 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  37.44 
 
 		 392 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  37.56 
 
 		 392 aa  275  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  36.92 
 
 		 409 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  36.44 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1956  aminotransferase  35.52 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.476214  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  30.61 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  34.15 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  34.45 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  29.84 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  31.06 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  31.37 
 
 		 385 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  34.39 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  32.34 
 
 		 392 aa  199  5e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  31.07 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  31.23 
 
 		 388 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  30.67 
 
 		 395 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  30.03 
 
 		 387 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  32.78 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  31.87 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  31.28 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  31.36 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  30.87 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  30.75 
 
 		 388 aa  192  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  30.69 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  29.92 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  29.92 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  29.92 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  29.92 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  29.92 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  29.92 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  30.25 
 
 		 395 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  31.27 
 
 		 380 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.25 
 
 		 396 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  31.97 
 
 		 397 aa  189  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  29.76 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  27.89 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  29.66 
 
 		 395 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.11 
 
 		 385 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  31.22 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  30 
 
 		 393 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  31.87 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  29.97 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  29.72 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  29.66 
 
 		 395 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  30.34 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  31.04 
 
 		 380 aa  186  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  29.81 
 
 		 386 aa  186  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  33.7 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  30.98 
 
 		 399 aa  186  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  29.11 
 
 		 397 aa  186  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  30.03 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  31.95 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  30.83 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  31.39 
 
 		 393 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  29.21 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  28.53 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  30.79 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  27.78 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  29.74 
 
 		 401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  28.61 
 
 		 388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  28.61 
 
 		 388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  30.11 
 
 		 393 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  28.15 
 
 		 390 aa  182  6e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  31.2 
 
 		 395 aa  182  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  30.92 
 
 		 395 aa  182  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  29.67 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  30.68 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  30.17 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  30.25 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  30.42 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  30.14 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  30.14 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  30.14 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  30.14 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  30.14 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30.14 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  30.51 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  32.3 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  32.96 
 
 		 386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  31.74 
 
 		 385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  33.8 
 
 		 388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  29.3 
 
 		 394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  31.1 
 
 		 409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  32.6 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  29.29 
 
 		 400 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  28.22 
 
 		 394 aa  179  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  30.39 
 
 		 379 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  30.11 
 
 		 396 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  27.53 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  30.85 
 
 		 387 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  30.39 
 
 		 393 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.151006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>