More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4355 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 385 aa  773    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  58.84 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  60.89 
 
 		 401 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  59.84 
 
 		 382 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  61.7 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  58.2 
 
 		 386 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  60.84 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  58.01 
 
 		 400 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  60.85 
 
 		 387 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  58.01 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  60.65 
 
 		 381 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  53.11 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  55.24 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.05 
 
 		 387 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  53.85 
 
 		 384 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  57.59 
 
 		 413 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  59.52 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  53.37 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  56.48 
 
 		 395 aa  391  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  52.08 
 
 		 389 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  54.57 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  53.56 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  53.47 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  52.79 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  52.6 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  52.6 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.26 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  57.41 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  51.2 
 
 		 409 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.35 
 
 		 402 aa  363  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.39 
 
 		 387 aa  355  8.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  50.54 
 
 		 397 aa  353  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  45.87 
 
 		 387 aa  352  8.999999999999999e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  51.32 
 
 		 388 aa  349  4e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.84 
 
 		 408 aa  349  4e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  47.34 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  48.41 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  47.93 
 
 		 395 aa  332  6e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  47.94 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  47.03 
 
 		 383 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  47.06 
 
 		 417 aa  312  6.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  45.95 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  47.03 
 
 		 384 aa  309  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  43.16 
 
 		 387 aa  309  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  44.36 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  46.11 
 
 		 383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  45.68 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  44.27 
 
 		 390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  44.05 
 
 		 394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  43.73 
 
 		 389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  42.36 
 
 		 384 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  45.7 
 
 		 409 aa  299  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  46.49 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  43.35 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  44.2 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  42.93 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  44.24 
 
 		 383 aa  293  5e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  42.93 
 
 		 399 aa  292  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  44.14 
 
 		 383 aa  292  7e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  42.67 
 
 		 390 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  45.33 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  42.51 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  38.99 
 
 		 390 aa  290  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  43.68 
 
 		 400 aa  289  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  40.21 
 
 		 385 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  39.68 
 
 		 379 aa  289  7e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  40.48 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  42.37 
 
 		 382 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  43.2 
 
 		 384 aa  286  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  43.27 
 
 		 389 aa  286  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  40.68 
 
 		 382 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  41.29 
 
 		 383 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  41.55 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  41.96 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  40.21 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  41.44 
 
 		 396 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  41.38 
 
 		 386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  42.13 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  40.48 
 
 		 386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  40.48 
 
 		 386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  41.98 
 
 		 390 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  41.98 
 
 		 390 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  41.15 
 
 		 391 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  39.53 
 
 		 382 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  39.01 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  41.71 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  40.21 
 
 		 386 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  40.78 
 
 		 394 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  40.21 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  41.18 
 
 		 390 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  40.21 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  40.21 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  40.21 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  39.57 
 
 		 385 aa  280  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  40.11 
 
 		 385 aa  280  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  40.11 
 
 		 385 aa  279  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  41.18 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  40.58 
 
 		 382 aa  278  8e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  40.31 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>