More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0680 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 387 aa  793    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  56.53 
 
 		 385 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  55.29 
 
 		 379 aa  429  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  52.24 
 
 		 398 aa  418  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  52.13 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  54.08 
 
 		 381 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  53.6 
 
 		 381 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  50.92 
 
 		 383 aa  398  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  42.49 
 
 		 394 aa  309  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  43.27 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  43.27 
 
 		 383 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  39.89 
 
 		 387 aa  283  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  43.32 
 
 		 383 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  39.06 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  40.27 
 
 		 381 aa  275  8e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  41.64 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  39.12 
 
 		 398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  39.42 
 
 		 386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  40.32 
 
 		 381 aa  269  7e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  43.02 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  39.22 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  39.78 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  38.34 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  38.34 
 
 		 398 aa  264  3e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  41.18 
 
 		 400 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  36.84 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  40.74 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  38.42 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  39.1 
 
 		 390 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  38.83 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  39.24 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  40 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  39.85 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  37.54 
 
 		 407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  40.06 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  39.73 
 
 		 400 aa  252  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  36.27 
 
 		 376 aa  250  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  36.16 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  37.53 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  37.89 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  40 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  38.44 
 
 		 404 aa  249  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  40.32 
 
 		 410 aa  248  9e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  37.18 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  36.96 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  38.34 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  40.27 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  38.9 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  40.79 
 
 		 393 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  36.04 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  38.06 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  37.96 
 
 		 387 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  37.23 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  34.68 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  38.36 
 
 		 393 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  35.37 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  38.83 
 
 		 390 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  36.72 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  36.04 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  36.04 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  36.04 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  36.04 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  32.49 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  37.77 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  36.04 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  36.04 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  39.3 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  37.21 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4903  aminotransferase class I and II  39.73 
 
 		 392 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234248  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  38.1 
 
 		 393 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  37.73 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  36.04 
 
 		 396 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  35.11 
 
 		 396 aa  243  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  39.67 
 
 		 393 aa  242  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  38.22 
 
 		 387 aa  243  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  35.86 
 
 		 401 aa  243  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  35.77 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  38.22 
 
 		 387 aa  242  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  35.21 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  36.94 
 
 		 383 aa  242  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  34.43 
 
 		 390 aa  242  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  36.99 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  35.14 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  36.65 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  37.4 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  35.01 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  35.01 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  36.55 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  36.65 
 
 		 380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  36.83 
 
 		 385 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  37.17 
 
 		 393 aa  239  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  33.68 
 
 		 387 aa  239  6.999999999999999e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  38.3 
 
 		 393 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  35.59 
 
 		 400 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  34.46 
 
 		 386 aa  239  8e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  34.86 
 
 		 395 aa  239  9e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  38.08 
 
 		 391 aa  238  9e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  36.41 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  36.95 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  34.46 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>