More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2408 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  87.99 
 
 		 383 aa  682    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 383 aa  778    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  60.53 
 
 		 393 aa  467  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  48.5 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  48.25 
 
 		 400 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  48.25 
 
 		 400 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  46.19 
 
 		 392 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  47.34 
 
 		 400 aa  343  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  47.59 
 
 		 400 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  47.46 
 
 		 398 aa  343  4e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  46.7 
 
 		 395 aa  342  7e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  48.1 
 
 		 400 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  46.15 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  44.07 
 
 		 389 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  47.22 
 
 		 400 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  46.41 
 
 		 393 aa  338  7e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  47.73 
 
 		 401 aa  338  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  47.22 
 
 		 400 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  46.84 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  49.11 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  47.22 
 
 		 400 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  47.09 
 
 		 400 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  46.72 
 
 		 400 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  46.72 
 
 		 400 aa  333  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  46.61 
 
 		 379 aa  333  2e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  46.33 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  46.72 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  46.6 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  47.68 
 
 		 393 aa  332  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  44.96 
 
 		 387 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  46.97 
 
 		 400 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  46.75 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  46.58 
 
 		 401 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  46.17 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  45.13 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  45.41 
 
 		 387 aa  328  9e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  46.21 
 
 		 400 aa  328  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  45.96 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  46.41 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  46.37 
 
 		 393 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  44.87 
 
 		 388 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  44.1 
 
 		 395 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  44.67 
 
 		 394 aa  326  5e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  46.46 
 
 		 400 aa  325  6e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  44.62 
 
 		 388 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  44.62 
 
 		 390 aa  325  7e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  44.3 
 
 		 389 aa  325  8.000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  47.93 
 
 		 400 aa  325  9e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  44.65 
 
 		 380 aa  325  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  45.8 
 
 		 399 aa  323  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  42.12 
 
 		 390 aa  323  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  45.29 
 
 		 399 aa  323  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  44.3 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  43.08 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  45.09 
 
 		 397 aa  323  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  45.29 
 
 		 395 aa  322  5e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  46.21 
 
 		 400 aa  322  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  45.66 
 
 		 396 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  43.08 
 
 		 395 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  43.08 
 
 		 395 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  43.08 
 
 		 395 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  43.08 
 
 		 395 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  43.08 
 
 		 395 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  42.82 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  44.02 
 
 		 390 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  44.07 
 
 		 392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  43.88 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  43.77 
 
 		 395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  45.84 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  44.81 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  45.24 
 
 		 397 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  45.5 
 
 		 397 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  43.33 
 
 		 395 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  44.91 
 
 		 380 aa  319  5e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  45.99 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  45.92 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  43.48 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  43.57 
 
 		 388 aa  316  4e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  44.62 
 
 		 397 aa  316  4e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  43.51 
 
 		 394 aa  316  5e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  44.44 
 
 		 400 aa  316  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  45.06 
 
 		 400 aa  316  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  45.23 
 
 		 400 aa  315  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  44.39 
 
 		 402 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  43.38 
 
 		 389 aa  315  9e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  45.14 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  43.19 
 
 		 390 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  43.51 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  44.53 
 
 		 402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  44.67 
 
 		 391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  43.29 
 
 		 400 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  44.13 
 
 		 404 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  43.54 
 
 		 400 aa  312  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  43.04 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  42.64 
 
 		 392 aa  310  2e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  43.85 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  43.48 
 
 		 409 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  43.69 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  43.4 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>