More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3278 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3278  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 401 aa  813    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1713  aminotransferase, class I and II  83.16 
 
 		 388 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1841  aminotransferase, class I and II  79.37 
 
 		 388 aa  631  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358223  normal  0.366913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1987  GntR family transcriptional regulator  79.84 
 
 		 388 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.675546  hitchhiker  0.00431824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2671  GntR family transcriptional regulator  79.17 
 
 		 385 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43130  putative aminotransferase  77.66 
 
 		 388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000231871  normal  0.186094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3618  putative aminotransferase  77.95 
 
 		 388 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2997  aminotransferase, class I  52.88 
 
 		 452 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.845231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2148  aminotransferase, class I and II  50.92 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2126  aminotransferase, class I and II  50.92 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.375573  normal  0.0326129 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2257  GntR family transcriptional regulator  49.87 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0771  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 392 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2869  GntR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 388 aa  299  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.400609  hitchhiker  0.00117486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 397 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  41.54 
 
 		 417 aa  265  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  33.42 
 
 		 396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 463 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  34.61 
 
 		 403 aa  252  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  36.29 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  37.97 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  36.15 
 
 		 394 aa  250  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 395 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  38.19 
 
 		 396 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 		 395 aa  249  6e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  38.19 
 
 		 396 aa  249  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 340 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  37.97 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 437 aa  245  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  35.2 
 
 		 397 aa  245  9e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  36.56 
 
 		 420 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  38.05 
 
 		 404 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  38.64 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  38.4 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  39.63 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 398 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  35.77 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  35.31 
 
 		 416 aa  243  6e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 399 aa  242  9e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 407 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.4 
 
 		 393 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  36.14 
 
 		 437 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  36.66 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  38.64 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  41.52 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  38.64 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  37.98 
 
 		 393 aa  240  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  38.13 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  38.26 
 
 		 426 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 409 aa  237  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 414 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  36.93 
 
 		 404 aa  236  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  33.25 
 
 		 397 aa  235  8e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  37.53 
 
 		 406 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  40.15 
 
 		 402 aa  235  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  34.28 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  35.46 
 
 		 400 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 441 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  38.4 
 
 		 393 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  38.4 
 
 		 393 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  38.4 
 
 		 393 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  38.4 
 
 		 393 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  38.4 
 
 		 393 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  38.72 
 
 		 393 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 450 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06472  aminotransferase  35.14 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 400 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  35.26 
 
 		 395 aa  230  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  38.56 
 
 		 416 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  35.75 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  35.75 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 498 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  34.94 
 
 		 430 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>