More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1987 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1987  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 388 aa  787    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.675546  hitchhiker  0.00431824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3278  GntR family transcriptional regulator  79.84 
 
 		 401 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1713  aminotransferase, class I and II  76.8 
 
 		 388 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1841  aminotransferase, class I and II  72.94 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358223  normal  0.366913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2671  GntR family transcriptional regulator  75.39 
 
 		 385 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43130  putative aminotransferase  73.71 
 
 		 388 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000231871  normal  0.186094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3618  putative aminotransferase  74.47 
 
 		 388 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2997  aminotransferase, class I  53.11 
 
 		 452 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.845231  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2126  aminotransferase, class I and II  52.12 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.375573  normal  0.0326129 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2148  aminotransferase, class I and II  52.12 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2257  GntR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0771  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2869  GntR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 388 aa  294  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.400609  hitchhiker  0.00117486 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  39.49 
 
 		 397 aa  265  8e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  41.03 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 395 aa  262  6e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  37.44 
 
 		 397 aa  260  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  40.45 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 398 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  40.35 
 
 		 396 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  40.35 
 
 		 396 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  36.93 
 
 		 400 aa  255  9e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  40.05 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  38.48 
 
 		 383 aa  252  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  33.42 
 
 		 396 aa  252  7e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  39.23 
 
 		 404 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  41.12 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  39.79 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 394 aa  250  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 403 aa  249  8e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  39.49 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 393 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  37.6 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  39.07 
 
 		 393 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 393 aa  246  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 399 aa  246  6e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  36.52 
 
 		 395 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 388 aa  245  9e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 414 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  39.07 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  37.53 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  39.07 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  38.82 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  39.07 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 450 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  37.06 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  35.24 
 
 		 420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  34.1 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  39.1 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  39.49 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  39.49 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  39.49 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  39.49 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  39.49 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  39.49 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 395 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 398 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 406 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  34.1 
 
 		 386 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 		 377 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 395 aa  239  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 463 aa  236  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  34.63 
 
 		 400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  35.28 
 
 		 394 aa  235  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  35.26 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  33.16 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  35.41 
 
 		 437 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 441 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 426 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  38.65 
 
 		 426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  36.71 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 394 aa  233  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 		 402 aa  233  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  34.3 
 
 		 498 aa  233  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 		 408 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  35.77 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  34.57 
 
 		 410 aa  229  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  34.57 
 
 		 410 aa  229  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 399 aa  229  6e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 441 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 416 aa  229  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>