More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1841 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1841  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 388 aa  792    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358223  normal  0.366913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1713  aminotransferase, class I and II  84.79 
 
 		 388 aa  658    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2671  GntR family transcriptional regulator  78.85 
 
 		 385 aa  615  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43130  putative aminotransferase  78.61 
 
 		 388 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000231871  normal  0.186094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3618  putative aminotransferase  79.74 
 
 		 388 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3278  GntR family transcriptional regulator  79.37 
 
 		 401 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1987  GntR family transcriptional regulator  72.94 
 
 		 388 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.675546  hitchhiker  0.00431824 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2997  aminotransferase, class I  50.66 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.845231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2148  aminotransferase, class I and II  48.94 
 
 		 386 aa  362  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2126  aminotransferase, class I and II  48.94 
 
 		 386 aa  362  6e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.375573  normal  0.0326129 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2257  GntR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 394 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0771  GntR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2869  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 388 aa  293  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.400609  hitchhiker  0.00117486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 397 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  38.48 
 
 		 383 aa  257  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  37.85 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  39.43 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  37.82 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  38.82 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  39.33 
 
 		 417 aa  246  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  38.64 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  35.4 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  39.43 
 
 		 393 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 395 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  38.34 
 
 		 393 aa  245  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  38.6 
 
 		 393 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 393 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 395 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 403 aa  243  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  38.6 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  34.94 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  38.6 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  36.66 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  34.37 
 
 		 400 aa  242  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 396 aa  242  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 437 aa  239  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  35.96 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  39.43 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  39.43 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  39.43 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  39.43 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  39.43 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  39.43 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 441 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  35.7 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  35.8 
 
 		 410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  35.8 
 
 		 410 aa  236  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  37.98 
 
 		 406 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 388 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  36.29 
 
 		 437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 398 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 395 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 402 aa  232  8.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 414 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 406 aa  232  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  33.76 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  35.43 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 393 aa  229  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 		 426 aa  229  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  35.13 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  34.02 
 
 		 416 aa  226  4e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06472  aminotransferase  35.31 
 
 		 382 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  33.93 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  36.94 
 
 		 377 aa  225  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  34.92 
 
 		 414 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 405 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  34.46 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 409 aa  223  6e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  34.2 
 
 		 386 aa  222  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  35.03 
 
 		 395 aa  222  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 450 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 416 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  34.68 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>