More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2869 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2869  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 388 aa  800    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.400609  hitchhiker  0.00117486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2997  aminotransferase, class I  43.46 
 
 		 452 aa  333  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.845231  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3618  putative aminotransferase  42.09 
 
 		 388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43130  putative aminotransferase  42.36 
 
 		 388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000231871  normal  0.186094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2671  GntR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1713  aminotransferase, class I and II  40.11 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1841  aminotransferase, class I and II  39.68 
 
 		 388 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358223  normal  0.366913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3278  GntR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 401 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1987  GntR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 388 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.675546  hitchhiker  0.00431824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0771  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  38 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  38 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2126  aminotransferase, class I and II  36.36 
 
 		 386 aa  260  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.375573  normal  0.0326129 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2148  aminotransferase, class I and II  36.36 
 
 		 386 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  37.03 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2257  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 394 aa  253  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 394 aa  252  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  34.87 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  36.09 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  36.02 
 
 		 417 aa  246  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  38.37 
 
 		 402 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  34.79 
 
 		 407 aa  242  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  36.2 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  36.06 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  36.79 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  37.15 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 393 aa  236  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 406 aa  235  9e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  36.76 
 
 		 420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 386 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  36.82 
 
 		 406 aa  233  5e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 426 aa  232  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 395 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  35.32 
 
 		 398 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  35.49 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  35.07 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  35.55 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  35.49 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 398 aa  230  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 		 463 aa  229  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 394 aa  229  7e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  34.63 
 
 		 404 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  33.86 
 
 		 404 aa  229  8e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  36.08 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 394 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  34.99 
 
 		 393 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  33.59 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  35.9 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  34.74 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  34.74 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 498 aa  226  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  34.88 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 397 aa  226  7e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 393 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  32.98 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  34.61 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  34.24 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  34.53 
 
 		 407 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  31.16 
 
 		 433 aa  222  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 425 aa  222  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  33.42 
 
 		 404 aa  220  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 436 aa  219  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  31.74 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  31.27 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 398 aa  215  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>