More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2257 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2148  aminotransferase, class I and II  97.97 
 
 		 386 aa  790    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2257  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 394 aa  816    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2126  aminotransferase, class I and II  97.97 
 
 		 386 aa  790    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.375573  normal  0.0326129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0771  GntR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1987  GntR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.675546  hitchhiker  0.00431824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3278  GntR family transcriptional regulator  49.87 
 
 		 401 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2671  GntR family transcriptional regulator  49.87 
 
 		 385 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1713  aminotransferase, class I and II  48.06 
 
 		 388 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3618  putative aminotransferase  48.84 
 
 		 388 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2997  aminotransferase, class I  49.23 
 
 		 452 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.845231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1841  aminotransferase, class I and II  47.67 
 
 		 388 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358223  normal  0.366913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43130  putative aminotransferase  48.84 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000231871  normal  0.186094 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  39.95 
 
 		 417 aa  263  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 407 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 406 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2869  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 388 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.400609  hitchhiker  0.00117486 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  36.91 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.1 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  37.35 
 
 		 420 aa  243  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  38.64 
 
 		 426 aa  239  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 426 aa  239  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  39.95 
 
 		 402 aa  236  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 410 aa  236  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  38.17 
 
 		 396 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  38.17 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  36.71 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 396 aa  234  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  35.44 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  35.44 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  36.8 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  36.46 
 
 		 463 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  36.39 
 
 		 406 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  36.71 
 
 		 393 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 		 398 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 450 aa  229  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 		 416 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  37.3 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  36.52 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  36.46 
 
 		 393 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  36.46 
 
 		 393 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 393 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 399 aa  225  9e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  36.29 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  36.46 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  33.91 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  33 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  38.06 
 
 		 402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 395 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 388 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  35.57 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 395 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 409 aa  219  8.999999999999998e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  34.37 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  32.69 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  35.34 
 
 		 393 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 405 aa  216  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  35.57 
 
 		 393 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 394 aa  212  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  34.24 
 
 		 401 aa  212  9e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  35.59 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  35.59 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  35.59 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  35.59 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  35.59 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3004  aminotransferase, class I and II  34.63 
 
 		 411 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.184923  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 437 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 		 395 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  34.17 
 
 		 408 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  34.17 
 
 		 408 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 395 aa  206  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  33.66 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  32.23 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  33.92 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>