More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2258 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2258  valine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 427 aa  874    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.782201  normal  0.105483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1090  valine--pyruvate transaminase  65.33 
 
 		 427 aa  608  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.294762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0165  class I/II aminotransferase  63.98 
 
 		 427 aa  595  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0914098  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4228  valine--pyruvate transaminase  66.03 
 
 		 419 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420595 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3688  valine--pyruvate transaminase  64.51 
 
 		 421 aa  582  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0050  valine--pyruvate transaminase  38.81 
 
 		 417 aa  325  8.000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2635  valine--pyruvate transaminase  37.89 
 
 		 416 aa  323  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00447  valine--pyruvate transaminase  36.84 
 
 		 417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1586  valine--pyruvate transaminase  37.59 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002002  valine--pyruvate aminotransferase  36.84 
 
 		 417 aa  319  7.999999999999999e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0014  valine--pyruvate transaminase  38.26 
 
 		 456 aa  315  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3895  valine--pyruvate transaminase  38.15 
 
 		 417 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03424  valine-pyruvate transaminase  37.91 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0138  aminotransferase class I and II  37.91 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3950  valine--pyruvate transaminase  37.91 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3775  valine--pyruvate transaminase  37.91 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0142  valine--pyruvate transaminase  37.91 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03375  hypothetical protein  37.91 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4948  valine--pyruvate transaminase  37.91 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.458288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4069  valine--pyruvate transaminase  37.91 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4140  valine--pyruvate transaminase  38.39 
 
 		 421 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3063  valine--pyruvate transaminase  37.5 
 
 		 420 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0062  valine--pyruvate transaminase  38.28 
 
 		 417 aa  312  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0053  valine--pyruvate transaminase  38.57 
 
 		 440 aa  312  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.100706 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0035  valine--pyruvate transaminase  39.09 
 
 		 418 aa  312  6.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0943  valine--pyruvate transaminase  37.77 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.784655  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0055  valine--pyruvate transaminase  37.83 
 
 		 416 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2500  valine--pyruvate transaminase  36.04 
 
 		 418 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2963  valine--pyruvate transaminase  35.89 
 
 		 415 aa  306  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0149  valine--pyruvate transaminase  37.05 
 
 		 416 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3725  valine--pyruvate transaminase  34.7 
 
 		 417 aa  306  6e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1771  valine--pyruvate transaminase  36.79 
 
 		 424 aa  303  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3879  valine--pyruvate transaminase  37.44 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4049  valine--pyruvate transaminase  37.44 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.714309 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3792  valine--pyruvate transaminase  39.6 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3863  valine--pyruvate transaminase  37.2 
 
 		 416 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3943  valine--pyruvate transaminase  37.2 
 
 		 416 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.796758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3988  valine--pyruvate transaminase  37.2 
 
 		 416 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1487  valine--pyruvate transaminase  34.66 
 
 		 424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.41369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1678  aminotransferase class I and II  34.91 
 
 		 426 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2440  valine--pyruvate transaminase  33.41 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2118  valine--pyruvate transaminase  32.81 
 
 		 443 aa  266  8e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0089  valine--pyruvate transaminase  34.33 
 
 		 434 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0903  valine--pyruvate transaminase  34.53 
 
 		 421 aa  262  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.176446  decreased coverage  0.0000000925124 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  27.09 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 402 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  24.27 
 
 		 401 aa  89  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  27.87 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  25.59 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9152  aspartate aminotransferase  28.36 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  25.14 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  23.73 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  22.25 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  22.51 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  20.97 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  24.35 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  25.48 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  24.35 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  25.85 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  26.61 
 
 		 392 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  25.35 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  26.29 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  25.88 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  25.86 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  26.51 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  26.11 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  23.12 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  27.71 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  23.99 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  26.09 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45065  predicted protein  22.8 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.368753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  24.23 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3278  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1088  aminotransferase class I and II  23.51 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  26.9 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  27.78 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06472  aminotransferase  25.06 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  27.14 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  24.93 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07291  aminotransferases class-I  23.75 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.122313  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  26.43 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  25.93 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  24.75 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  23.87 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0078  putative aminotransferase  26.7 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  25.73 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  23.11 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0746  aminotransferase class I and II  29.11 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000316977  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  26.08 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>