More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_45065 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_45065  predicted protein  100 
 
 
434 aa  894    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.368753 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05616  kynurenine aminotransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11190)  50.72 
 
 
418 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0167824 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00190  aminotransferase, putative  40.48 
 
 
460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00967249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  34.63 
 
 
387 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  36.01 
 
 
397 aa  239  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  34.96 
 
 
395 aa  226  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  34.02 
 
 
387 aa  223  4e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  34.96 
 
 
391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10073  predicted protein  32.63 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10257  predicted protein  32.85 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.144929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  36.26 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  34.63 
 
 
385 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  32.74 
 
 
388 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  35.63 
 
 
392 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  33.5 
 
 
390 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  32.94 
 
 
383 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  36.53 
 
 
391 aa  209  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  33.33 
 
 
391 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 
383 aa  209  9e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  33.5 
 
 
390 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  33.08 
 
 
383 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  33.84 
 
 
409 aa  206  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  34.87 
 
 
421 aa  206  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  33.83 
 
 
397 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  33.02 
 
 
413 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 
381 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  34.1 
 
 
391 aa  203  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  34.19 
 
 
395 aa  204  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  32.38 
 
 
413 aa  203  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  32.2 
 
 
382 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  32.44 
 
 
386 aa  202  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  31.54 
 
 
401 aa  202  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  34.1 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  30.59 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  30.79 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  32.03 
 
 
399 aa  201  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  32.05 
 
 
389 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  32.68 
 
 
394 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  34.62 
 
 
387 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  30.64 
 
 
393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  34.79 
 
 
374 aa  199  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  35.22 
 
 
408 aa  199  7e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  32.3 
 
 
384 aa  199  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  32.74 
 
 
413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  31.96 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  32.57 
 
 
402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  32.23 
 
 
400 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  32.42 
 
 
385 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  34.45 
 
 
382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  30.54 
 
 
382 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  32.04 
 
 
394 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  32.47 
 
 
393 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  33.66 
 
 
388 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  33.25 
 
 
390 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  33.66 
 
 
391 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  30.73 
 
 
382 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  35.56 
 
 
397 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  30.54 
 
 
382 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  32.48 
 
 
394 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  32.02 
 
 
384 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  31.8 
 
 
389 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  31.87 
 
 
394 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  30.73 
 
 
382 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  32.44 
 
 
386 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  32.64 
 
 
383 aa  193  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  31.28 
 
 
382 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0752  aminotransferase, class I and II  31.3 
 
 
399 aa  193  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  31.61 
 
 
387 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  33.17 
 
 
389 aa  192  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  31.07 
 
 
394 aa  192  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  31.77 
 
 
382 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  32.17 
 
 
384 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
387 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  30.08 
 
 
397 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  31.54 
 
 
390 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  32.65 
 
 
409 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  31.62 
 
 
384 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  34.45 
 
 
397 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  32.2 
 
 
391 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0220  aminotransferase class I and II  30.71 
 
 
385 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  31.03 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  30 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  31.54 
 
 
396 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  31.73 
 
 
421 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  31.16 
 
 
389 aa  190  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  31.3 
 
 
390 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  32.12 
 
 
391 aa  190  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  30 
 
 
382 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0778  aminotransferase class I and II  30.56 
 
 
380 aa  189  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3182  putative aminotransferase  31.54 
 
 
390 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429076  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  31.3 
 
 
390 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  30.51 
 
 
385 aa  189  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  30.51 
 
 
417 aa  188  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  31.3 
 
 
390 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  31.3 
 
 
390 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1518  aminotransferase class I and II  32.91 
 
 
374 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.489896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  30.71 
 
 
384 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  30.49 
 
 
402 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  32.12 
 
 
384 aa  187  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  30.73 
 
 
389 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>