More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0633 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  100 
 
 
394 aa  813    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  77.49 
 
 
384 aa  631  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  77.49 
 
 
384 aa  631  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  46.35 
 
 
387 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  46.09 
 
 
387 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  46.09 
 
 
385 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  45.83 
 
 
387 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  45.57 
 
 
387 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  45.83 
 
 
387 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  46.09 
 
 
387 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  45.97 
 
 
387 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  45.83 
 
 
387 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  45.83 
 
 
387 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  45.05 
 
 
387 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  42.56 
 
 
382 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  43.72 
 
 
385 aa  338  8e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  41.62 
 
 
398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  42.78 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  40.59 
 
 
391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  42.63 
 
 
391 aa  301  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  41.03 
 
 
407 aa  293  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  37.05 
 
 
386 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  39.18 
 
 
397 aa  291  1e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  37.47 
 
 
390 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  39.32 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  39.32 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  39.32 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  39.32 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  37.84 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  39.32 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  38.8 
 
 
396 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  38.8 
 
 
396 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  37.24 
 
 
396 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  36.93 
 
 
392 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  36.93 
 
 
392 aa  280  4e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  37.47 
 
 
387 aa  279  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  38.26 
 
 
396 aa  279  7e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  36.68 
 
 
391 aa  278  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  38.54 
 
 
396 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  38.54 
 
 
396 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  37.86 
 
 
396 aa  275  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  35.71 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0895  aminotransferase  39.64 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.515472  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  37.36 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  34.97 
 
 
388 aa  271  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  33.51 
 
 
393 aa  270  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  37.26 
 
 
399 aa  268  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  35.58 
 
 
404 aa  265  7e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  35.99 
 
 
399 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  37.05 
 
 
394 aa  265  8.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  36.39 
 
 
401 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0044  aromatic amino acid aminotransferase  37.05 
 
 
395 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  34.97 
 
 
398 aa  261  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  38.89 
 
 
386 aa  261  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  34.97 
 
 
398 aa  260  3e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  35.08 
 
 
402 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  35.7 
 
 
387 aa  259  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  33.16 
 
 
397 aa  259  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  35.5 
 
 
391 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  35.96 
 
 
390 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  33.85 
 
 
398 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  34.33 
 
 
380 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1353  L-aspartate aminotransferase  37.13 
 
 
391 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1377  aromatic amino acid aminotransferase  38.99 
 
 
400 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.907839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  34.96 
 
 
386 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  34.03 
 
 
405 aa  257  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  34.24 
 
 
385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  33.88 
 
 
380 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0777  aromatic amino acid aminotransferase  35.86 
 
 
390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  35.23 
 
 
393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  32.81 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1200  aminotransferase  37.13 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.241319  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  35.14 
 
 
385 aa  252  8.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  37.17 
 
 
390 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 
410 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  32.9 
 
 
381 aa  251  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  34.32 
 
 
387 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  36.34 
 
 
394 aa  249  8e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  33.94 
 
 
385 aa  244  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  32.88 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  34.55 
 
 
379 aa  243  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  35.14 
 
 
393 aa  243  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  35.01 
 
 
379 aa  243  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  37.85 
 
 
385 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  34.25 
 
 
377 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  34.25 
 
 
377 aa  241  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
381 aa  240  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.57 
 
 
394 aa  239  5e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  33.78 
 
 
387 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  32.98 
 
 
388 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  32.55 
 
 
380 aa  238  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
395 aa  236  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0894  aminotransferase  34.95 
 
 
392 aa  236  8e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.992063  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  36.05 
 
 
370 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  33.15 
 
 
383 aa  232  8.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  33.59 
 
 
395 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  34.4 
 
 
392 aa  231  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  33.99 
 
 
381 aa  229  8e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  36.08 
 
 
367 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>