More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2163 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  100 
 
 
380 aa  766    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  97.63 
 
 
380 aa  749    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  43.12 
 
 
387 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  42.59 
 
 
385 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  42.86 
 
 
387 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  42.86 
 
 
387 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  42.59 
 
 
387 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  42.06 
 
 
387 aa  332  5e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  41.8 
 
 
387 aa  331  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  42.18 
 
 
387 aa  331  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  42.59 
 
 
387 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  42.59 
 
 
387 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  42.82 
 
 
407 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  42.18 
 
 
382 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  41.62 
 
 
387 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  41.95 
 
 
388 aa  322  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  40.68 
 
 
385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  41.84 
 
 
386 aa  315  6e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  39.68 
 
 
388 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  41.76 
 
 
396 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  41.49 
 
 
396 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  41.49 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  41.49 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  41.49 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  41.49 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  40.96 
 
 
396 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  40.47 
 
 
396 aa  309  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  40.69 
 
 
396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  41.69 
 
 
398 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  40.21 
 
 
396 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  39.1 
 
 
392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  38.83 
 
 
392 aa  306  6e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  39.89 
 
 
396 aa  305  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  39.11 
 
 
390 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  38.81 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  39.63 
 
 
390 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 
387 aa  299  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  40.22 
 
 
404 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  37.27 
 
 
393 aa  293  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  39.15 
 
 
385 aa  293  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  39.63 
 
 
390 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  39.08 
 
 
385 aa  292  7e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  36.75 
 
 
386 aa  289  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  39.46 
 
 
395 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  39.11 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  38.52 
 
 
385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  38.28 
 
 
397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  39.46 
 
 
370 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  38.26 
 
 
401 aa  282  6.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  38.27 
 
 
393 aa  281  9e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  38.42 
 
 
391 aa  281  1e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  35.39 
 
 
387 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  37.17 
 
 
405 aa  277  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  37.07 
 
 
383 aa  276  5e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 
402 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  40.05 
 
 
398 aa  276  6e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  36.75 
 
 
391 aa  273  3e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  35.66 
 
 
388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  37.63 
 
 
410 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  35.39 
 
 
388 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  36.46 
 
 
391 aa  271  9e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  39.52 
 
 
398 aa  271  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  39.25 
 
 
398 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  35.9 
 
 
391 aa  268  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  37.84 
 
 
375 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  38.21 
 
 
375 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  36.91 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  37.27 
 
 
367 aa  265  7e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  36.53 
 
 
381 aa  265  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  38.01 
 
 
393 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  36.7 
 
 
387 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  35.45 
 
 
399 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  37.63 
 
 
387 aa  264  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  35.04 
 
 
400 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  38.38 
 
 
399 aa  262  6e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  35.7 
 
 
386 aa  262  6.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  36.14 
 
 
381 aa  262  8.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.96 
 
 
379 aa  261  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 
380 aa  260  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0994  aminotransferase  37.53 
 
 
369 aa  259  6e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  37.83 
 
 
394 aa  258  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  37.3 
 
 
375 aa  258  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  35.16 
 
 
397 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  37.13 
 
 
375 aa  258  2e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  34.64 
 
 
394 aa  257  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  36.68 
 
 
375 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  37.6 
 
 
401 aa  257  3e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  36.97 
 
 
368 aa  256  4e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  33.88 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  33.25 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  35.22 
 
 
371 aa  253  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  35.62 
 
 
367 aa  251  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2538  aminotransferase class I and II  35.39 
 
 
373 aa  250  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.408129  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  35.12 
 
 
373 aa  250  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  34.47 
 
 
379 aa  249  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  34.55 
 
 
386 aa  245  8e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  34.32 
 
 
373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  33.91 
 
 
380 aa  243  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  34.08 
 
 
387 aa  243  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>