More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1584 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  100 
 
 
379 aa  777    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  68.34 
 
 
381 aa  544  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  64.19 
 
 
385 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  61.52 
 
 
383 aa  481  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  60.11 
 
 
381 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  58.93 
 
 
384 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  55.29 
 
 
387 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  51.96 
 
 
398 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  42.71 
 
 
394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  42.41 
 
 
385 aa  298  9e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  40.16 
 
 
390 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  38.58 
 
 
395 aa  279  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  41.11 
 
 
388 aa  278  8e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  40.62 
 
 
383 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  40.62 
 
 
378 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  37.76 
 
 
386 aa  272  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  39.63 
 
 
390 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  37.01 
 
 
388 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  40.22 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  39.15 
 
 
390 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  40.89 
 
 
383 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  40.53 
 
 
393 aa  266  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  39.48 
 
 
391 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  34.6 
 
 
395 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  39.66 
 
 
387 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  40 
 
 
383 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  37.7 
 
 
387 aa  263  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  39.39 
 
 
385 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  37.5 
 
 
397 aa  262  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  39.39 
 
 
387 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  36.13 
 
 
392 aa  262  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  39.32 
 
 
386 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  35.96 
 
 
376 aa  261  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  39.39 
 
 
387 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  38.48 
 
 
398 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  38.9 
 
 
390 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  35.49 
 
 
388 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  39.5 
 
 
387 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  38.97 
 
 
400 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  41.78 
 
 
387 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  37.82 
 
 
396 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  39.11 
 
 
387 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  39.39 
 
 
387 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  39.66 
 
 
387 aa  259  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  39.11 
 
 
387 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  39.11 
 
 
387 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  40.31 
 
 
390 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  37.97 
 
 
398 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  39.32 
 
 
379 aa  258  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  38.36 
 
 
393 aa  257  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  38.26 
 
 
383 aa  256  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  37.24 
 
 
394 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  39.01 
 
 
400 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  36.25 
 
 
396 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  38.4 
 
 
381 aa  256  5e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  35.06 
 
 
398 aa  256  5e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  39.74 
 
 
389 aa  256  6e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  41.88 
 
 
391 aa  255  8e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  42.82 
 
 
388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  38.56 
 
 
395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  36.32 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  38.56 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  40.06 
 
 
404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  37.56 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  34.81 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  37.6 
 
 
394 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  37.31 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  37.56 
 
 
396 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  37.31 
 
 
396 aa  252  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  37.06 
 
 
396 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  39.01 
 
 
381 aa  252  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  37.06 
 
 
396 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  37.06 
 
 
396 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  36.76 
 
 
402 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  37.06 
 
 
396 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  39.08 
 
 
392 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  37.06 
 
 
396 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  38.38 
 
 
394 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  37.06 
 
 
396 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  37.06 
 
 
397 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  39.36 
 
 
390 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  38.06 
 
 
387 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  37.84 
 
 
393 aa  249  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  35.32 
 
 
389 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  38.11 
 
 
393 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  34.35 
 
 
397 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  35.57 
 
 
384 aa  249  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  35.57 
 
 
384 aa  249  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  34.1 
 
 
397 aa  249  7e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  37.8 
 
 
387 aa  249  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  38.31 
 
 
382 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  39.53 
 
 
398 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  34.29 
 
 
398 aa  248  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  38.72 
 
 
410 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  38.99 
 
 
400 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  37.89 
 
 
395 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  39.04 
 
 
370 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  35.94 
 
 
407 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  38.1 
 
 
393 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  37.63 
 
 
394 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.470485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>