More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1200 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1200  aminotransferase  100 
 
 		 393 aa  812    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.241319  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  45.74 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  43.93 
 
 		 391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0044  aromatic amino acid aminotransferase  48.25 
 
 		 395 aa  343  4e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  43.34 
 
 		 394 aa  339  5.9999999999999996e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  48.24 
 
 		 394 aa  336  5e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  45.77 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  43.12 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  43.95 
 
 		 391 aa  329  5.0000000000000004e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1377  aromatic amino acid aminotransferase  44.09 
 
 		 400 aa  322  8e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.907839  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0333  aminotransferase  45.04 
 
 		 404 aa  319  3.9999999999999996e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0777  aromatic amino acid aminotransferase  41.42 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  42.39 
 
 		 382 aa  309  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  42.45 
 
 		 398 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  39.59 
 
 		 404 aa  296  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  39.28 
 
 		 387 aa  292  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  39.53 
 
 		 387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  39.02 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  39.28 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  41.41 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  39.02 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0895  aminotransferase  37.53 
 
 		 393 aa  287  2.9999999999999996e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.515472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  40.16 
 
 		 396 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  39.34 
 
 		 407 aa  285  8e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  38.76 
 
 		 387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  38.87 
 
 		 387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  38.76 
 
 		 387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  39.39 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  39.13 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  40.16 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  40.16 
 
 		 396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  40.16 
 
 		 396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  40.16 
 
 		 396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  40.16 
 
 		 396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  39.89 
 
 		 396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  39.89 
 
 		 396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  38.5 
 
 		 385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  39.63 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  39.63 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  40.43 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  39.3 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  38.21 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1353  L-aspartate aminotransferase  37.95 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  40.27 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  40.54 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  41.24 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  37.43 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  37.5 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  38.56 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  36.46 
 
 		 392 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  37.93 
 
 		 383 aa  266  7e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  37.14 
 
 		 400 aa  265  8e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  37.56 
 
 		 387 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  36.2 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  37.98 
 
 		 384 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  37.98 
 
 		 384 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  36.65 
 
 		 396 aa  262  8e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  36.29 
 
 		 397 aa  262  8.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  36.1 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  36.83 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  37.37 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  36.87 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  39.51 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  37.69 
 
 		 387 aa  256  5e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  37.31 
 
 		 388 aa  255  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  34.91 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  37.83 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  37.79 
 
 		 386 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  35.46 
 
 		 399 aa  253  3e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  36.83 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  37.13 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  32.82 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  35.55 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  35.84 
 
 		 391 aa  249  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  38.34 
 
 		 410 aa  250  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  34.7 
 
 		 402 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  34.97 
 
 		 385 aa  249  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  36.6 
 
 		 381 aa  249  9e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  35.75 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  38.82 
 
 		 396 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  35.32 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  36.92 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  38.23 
 
 		 390 aa  246  6.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  34.96 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  35.83 
 
 		 398 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0894  aminotransferase  33.42 
 
 		 392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.992063  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  37.3 
 
 		 380 aa  243  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  36.1 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  38.31 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  35.54 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  35.69 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  36.49 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  33.76 
 
 		 387 aa  240  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  35.56 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  35.29 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  37.77 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  37.57 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3038  aminotransferase class I and II  37.13 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000279526 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  36.72 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>