More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0617 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  100 
 
 		 394 aa  806    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  58.52 
 
 		 394 aa  480  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  51.27 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0044  aromatic amino acid aminotransferase  46.82 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  45.74 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  46.89 
 
 		 391 aa  364  2e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0777  aromatic amino acid aminotransferase  45.13 
 
 		 390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  46.09 
 
 		 391 aa  359  4e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0333  aminotransferase  45.27 
 
 		 404 aa  352  5e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1377  aromatic amino acid aminotransferase  46.44 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.907839  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1200  aminotransferase  43.34 
 
 		 393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.241319  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1353  L-aspartate aminotransferase  40.42 
 
 		 391 aa  318  7.999999999999999e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  42.13 
 
 		 404 aa  308  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0895  aminotransferase  41.14 
 
 		 393 aa  303  5.000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.515472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  40.68 
 
 		 390 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  39.95 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  39.64 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  40.96 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  39.12 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  38.89 
 
 		 396 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  40 
 
 		 388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  39.15 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  39.54 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  40.31 
 
 		 392 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  40.31 
 
 		 392 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  38.89 
 
 		 396 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  38.89 
 
 		 396 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  38.89 
 
 		 396 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  38.89 
 
 		 396 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  38.62 
 
 		 396 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  38.89 
 
 		 396 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  38.62 
 
 		 396 aa  285  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  37.11 
 
 		 382 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  38.28 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  39.52 
 
 		 387 aa  285  9e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  39.12 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  38.36 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  38.74 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  40.57 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  39.38 
 
 		 391 aa  283  5.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  38.32 
 
 		 387 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  37.86 
 
 		 387 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  37.86 
 
 		 387 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  37.96 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  37.86 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  38.76 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  35.79 
 
 		 391 aa  280  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  38.76 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  39.68 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  37.6 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  37.6 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  38.01 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  37.8 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  37.17 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  37.8 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  38.34 
 
 		 402 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  37.27 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  36.1 
 
 		 386 aa  276  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  36.65 
 
 		 398 aa  276  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  37.88 
 
 		 393 aa  276  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  36.75 
 
 		 387 aa  275  9e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  37.04 
 
 		 393 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  37.8 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  39.68 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  36.98 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0894  aminotransferase  36.36 
 
 		 392 aa  269  8e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.992063  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  35.19 
 
 		 385 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  38.14 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  38.06 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  37.67 
 
 		 387 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  38.02 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  38.83 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  37.05 
 
 		 394 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  37.92 
 
 		 386 aa  265  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  37.89 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  36.27 
 
 		 386 aa  262  8e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  36.34 
 
 		 405 aa  262  8e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  38.28 
 
 		 385 aa  262  8.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  36.41 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  34.9 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  36 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  35.06 
 
 		 400 aa  258  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  34.64 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  35.62 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  36.07 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  35.18 
 
 		 410 aa  255  8e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  37.99 
 
 		 379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  36.88 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  37.43 
 
 		 387 aa  249  8e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  37.86 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  37.97 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  38.13 
 
 		 380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  37.08 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  37.23 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  35.54 
 
 		 367 aa  237  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  36.65 
 
 		 376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  36.36 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  37.36 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>