More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9152 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9152  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 409 aa  833    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3437  aspartate aminotransferase  68.81 
 
 		 406 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3082  aspartate aminotransferase  68.56 
 
 		 406 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.410031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2060  aspartate aminotransferase  68.81 
 
 		 405 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3422  aspartate aminotransferase  66.83 
 
 		 410 aa  543  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  28.23 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  28.03 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  27.76 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  25.95 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  26.96 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 		 373 aa  130  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  26.17 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  25.21 
 
 		 399 aa  126  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  27.2 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  29.09 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  24.57 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  29.38 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  27.54 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  26.55 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  24.6 
 
 		 402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  25.98 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  28.88 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  29.13 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  26.04 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  27.82 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  30.5 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  26.91 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  26.92 
 
 		 367 aa  120  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  27.7 
 
 		 367 aa  120  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  25 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  29.25 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  23.98 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1088  aminotransferase class I and II  25 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  28.87 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  27.52 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  25.9 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  28.23 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  25.7 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  26.26 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  26.18 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  28.18 
 
 		 400 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  27.27 
 
 		 387 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  28.88 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  25.75 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  27.15 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  26.1 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  25 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  23.63 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  23.99 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  26.72 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  26.84 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  26.04 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  26.19 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  26.46 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  25.68 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  23.99 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  26.76 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  28.06 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  22.65 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  25.07 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  24.12 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  26.84 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  28.19 
 
 		 373 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  27.96 
 
 		 371 aa  113  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  23.46 
 
 		 375 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  25 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  25.81 
 
 		 397 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  27.45 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  24.73 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  24.4 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  27.25 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  25.81 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  25.43 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1559  putative aminotransferase  25.78 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000413042  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  25.98 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  26.67 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  24.3 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  22.91 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  25.8 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  25 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  27.03 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  25.93 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2591  aspartate aminotransferase  26.53 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0994  aminotransferase  27.03 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  27.19 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  27.25 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  25.95 
 
 		 387 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  27.18 
 
 		 402 aa  110  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  24.79 
 
 		 385 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  27.21 
 
 		 404 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  26.44 
 
 		 405 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  25.21 
 
 		 388 aa  109  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  26.69 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  26.52 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  28.05 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4172  aminotransferase  26.15 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000308334  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  26.54 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  27.93 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  25.47 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  24.85 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>