More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0346 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  81.93 
 
 		 403 aa  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 399 aa  810    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  79.37 
 
 		 395 aa  622  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  75.72 
 
 		 410 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  72.7 
 
 		 408 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  72.89 
 
 		 408 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  71.88 
 
 		 402 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  70.94 
 
 		 400 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  70.98 
 
 		 400 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  70.94 
 
 		 400 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  70.94 
 
 		 400 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  70.71 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  56.81 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  55.87 
 
 		 385 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  55.91 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  55.22 
 
 		 395 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  56.15 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  55.9 
 
 		 402 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  53 
 
 		 385 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  53.52 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  53.93 
 
 		 384 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  45.76 
 
 		 406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  44.89 
 
 		 398 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  45.11 
 
 		 388 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  41.82 
 
 		 395 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  42.36 
 
 		 388 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  42.41 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  41.51 
 
 		 388 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  41.71 
 
 		 403 aa  285  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  39.46 
 
 		 410 aa  285  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  42.89 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  40.7 
 
 		 388 aa  282  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  39.95 
 
 		 381 aa  223  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  35.14 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  35.39 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 392 aa  215  9e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  33.16 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  36.02 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  31.32 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.16 
 
 		 444 aa  209  7e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  32.5 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  33.77 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  33.77 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  32.72 
 
 		 391 aa  202  6e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  33.16 
 
 		 393 aa  202  8e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  32.2 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  35.53 
 
 		 382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  32.79 
 
 		 392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  32.1 
 
 		 384 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  32.1 
 
 		 384 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  30.67 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  30.67 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  30.41 
 
 		 387 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  30.15 
 
 		 387 aa  196  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.45 
 
 		 379 aa  196  9e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  32.9 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  30.41 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  29.64 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  30.41 
 
 		 387 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  29.9 
 
 		 385 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  29.9 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 		 387 aa  192  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  31.4 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  34.46 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  29.84 
 
 		 396 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  32.57 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  29.64 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  34.86 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  32.46 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  34.99 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  35.2 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  32.29 
 
 		 405 aa  189  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  30.93 
 
 		 385 aa  189  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  31.56 
 
 		 375 aa  189  8e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  31.69 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  30.14 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  32.96 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  29.95 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  29.84 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  28.28 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  29.64 
 
 		 398 aa  188  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  30.55 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  29.43 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  30.85 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  31.17 
 
 		 397 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  31.09 
 
 		 386 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  32.7 
 
 		 388 aa  187  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  32.88 
 
 		 376 aa  187  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  29.95 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  31.69 
 
 		 393 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  31.54 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  29.69 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  29.69 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  29.43 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  29.69 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  32.12 
 
 		 402 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  29.69 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  30.92 
 
 		 377 aa  186  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>