More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0113 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  99.5 
 
 
402 aa  806    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  100 
 
 
402 aa  811    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  57.32 
 
 
395 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  59.38 
 
 
402 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  58.79 
 
 
400 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  56.15 
 
 
399 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  57.59 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  56.33 
 
 
410 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  55.31 
 
 
403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  55.39 
 
 
408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  59.32 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  55.47 
 
 
385 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  57.85 
 
 
400 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  54.38 
 
 
390 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  57.85 
 
 
400 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  54.66 
 
 
408 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  54.55 
 
 
388 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  53.14 
 
 
385 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  54.19 
 
 
388 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  53.06 
 
 
395 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  53.44 
 
 
384 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  41.9 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  41.98 
 
 
388 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  40.37 
 
 
388 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  41.25 
 
 
401 aa  276  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  40.92 
 
 
406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  42.04 
 
 
403 aa  272  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  41.13 
 
 
388 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  38.1 
 
 
395 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  37.18 
 
 
388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  40.85 
 
 
427 aa  252  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  38.22 
 
 
410 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  44.21 
 
 
381 aa  237  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  34.37 
 
 
384 aa  193  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  34.88 
 
 
412 aa  192  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  34.24 
 
 
392 aa  189  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  30.26 
 
 
387 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  35.46 
 
 
397 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  31.36 
 
 
399 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  29.46 
 
 
375 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  32.3 
 
 
382 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  31.61 
 
 
398 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  29.12 
 
 
382 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  30.49 
 
 
387 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  30.23 
 
 
387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  30.83 
 
 
386 aa  180  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  32.4 
 
 
400 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  30.49 
 
 
387 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  30.08 
 
 
385 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  30.23 
 
 
387 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  31.18 
 
 
385 aa  176  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  30.23 
 
 
387 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  32.9 
 
 
404 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  32.47 
 
 
393 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  28.86 
 
 
387 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  32.71 
 
 
383 aa  176  7e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  31.33 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  33.25 
 
 
444 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.61 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  29.97 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  32.49 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  32.49 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  29.72 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  29.97 
 
 
387 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  29.82 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  35.59 
 
 
409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  29.97 
 
 
387 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  31.95 
 
 
391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  31.78 
 
 
389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  32.18 
 
 
411 aa  172  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  29.24 
 
 
402 aa  172  9e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  33.69 
 
 
414 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  32.98 
 
 
460 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0079  aminotransferase class I and II  31.98 
 
 
392 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  31.69 
 
 
393 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  31.56 
 
 
412 aa  171  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  30.14 
 
 
392 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  32.24 
 
 
399 aa  171  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  28.92 
 
 
396 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  29.67 
 
 
390 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  31.12 
 
 
392 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1423  aminotransferase  32.26 
 
 
384 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  31.54 
 
 
393 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  30.65 
 
 
385 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  31.12 
 
 
392 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 
395 aa  170  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  32.88 
 
 
392 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  30.26 
 
 
376 aa  169  7e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  29.48 
 
 
390 aa  169  8e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  29.24 
 
 
399 aa  169  9e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  31.94 
 
 
393 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  29.56 
 
 
384 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  30.53 
 
 
380 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  32.27 
 
 
397 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  32.31 
 
 
387 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  31.28 
 
 
393 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  31.75 
 
 
397 aa  168  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  30.32 
 
 
370 aa  168  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  30.46 
 
 
393 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>