More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3262 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 395 aa  801    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  88.54 
 
 		 384 aa  706    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  76.9 
 
 		 385 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  70.2 
 
 		 385 aa  557  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  69.54 
 
 		 390 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  66.67 
 
 		 388 aa  539  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  68.42 
 
 		 388 aa  531  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  56.63 
 
 		 395 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  57.14 
 
 		 410 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  55.22 
 
 		 399 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  55.89 
 
 		 408 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  56.17 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  57.91 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  57.65 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  56.38 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  55.39 
 
 		 408 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  58.16 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  56.38 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  56.38 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  53.06 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  53.06 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  41.3 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  38.93 
 
 		 388 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  43.26 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  40.62 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  40.49 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  40.27 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  40.82 
 
 		 406 aa  259  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  41.52 
 
 		 401 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  41.3 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  39.8 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  38.93 
 
 		 427 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  36.67 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  34.86 
 
 		 412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  31.62 
 
 		 377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  31.62 
 
 		 377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  35.22 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  32.07 
 
 		 444 aa  176  9e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  31.47 
 
 		 399 aa  176  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  29.19 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  33.08 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  32.59 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  30.25 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  34.43 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  29.52 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0207  aspartate aminotransferase  31.25 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  32.14 
 
 		 397 aa  170  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  30.93 
 
 		 402 aa  169  8e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  35.42 
 
 		 392 aa  169  8e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  30.13 
 
 		 376 aa  169  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  31.3 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.54 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  31.18 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  29.52 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  27.99 
 
 		 401 aa  167  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  32.35 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  33.33 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  31.08 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  34.24 
 
 		 396 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  31.27 
 
 		 391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  29.77 
 
 		 396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  32.35 
 
 		 379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  29.31 
 
 		 392 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  29.05 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  31.25 
 
 		 401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  31.78 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  29.86 
 
 		 382 aa  162  7e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  28.87 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  31 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  28.92 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  30.75 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  30.46 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  28.27 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  29.31 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  28.07 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  30 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  28.27 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  29.95 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  35.03 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  31.23 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  32.15 
 
 		 400 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  29.85 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  29.85 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  28.9 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  30.79 
 
 		 381 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  28.68 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  32.16 
 
 		 387 aa  159  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  29.92 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  30.6 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  31.31 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  31.46 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1431  aminotransferase class I and II  29.74 
 
 		 391 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000143032 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  29.01 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  27.02 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  30.87 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  29.35 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  31.41 
 
 		 409 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  30.6 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>