More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1418 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  88.54 
 
 		 395 aa  706    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 384 aa  781    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  73.75 
 
 		 385 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  70.16 
 
 		 390 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  68.83 
 
 		 385 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  67.7 
 
 		 388 aa  514  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  65.63 
 
 		 388 aa  505  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  55.38 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  55.41 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  53.93 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  55.12 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  54.64 
 
 		 408 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  53.47 
 
 		 403 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  55.5 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  55.5 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  55.76 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  55.76 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  55.76 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  56.02 
 
 		 400 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  53.44 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  53.17 
 
 		 402 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  42.45 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  39.32 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  39.11 
 
 		 388 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  38.8 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  40.16 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  39.37 
 
 		 395 aa  256  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  40.73 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  38.06 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  40.47 
 
 		 401 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 		 410 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  37.53 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  35.41 
 
 		 412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  38.44 
 
 		 381 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  33.51 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  34.92 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  31.81 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0207  aspartate aminotransferase  31.52 
 
 		 376 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  33.97 
 
 		 384 aa  177  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  32.81 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  29.6 
 
 		 401 aa  176  7e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  31.08 
 
 		 377 aa  176  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  31.08 
 
 		 377 aa  176  9e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  31 
 
 		 380 aa  172  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  30.37 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  32.87 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  30.55 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  32.4 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  29.87 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  30.33 
 
 		 386 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  30 
 
 		 393 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 		 397 aa  169  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  32.8 
 
 		 392 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  31.16 
 
 		 370 aa  169  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  31.41 
 
 		 391 aa  169  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  34.6 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  30.91 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  28.73 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  29.73 
 
 		 379 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  31.28 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  32.29 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  32.04 
 
 		 390 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  33.24 
 
 		 379 aa  166  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  30.69 
 
 		 401 aa  166  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  30.35 
 
 		 392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  31.15 
 
 		 392 aa  166  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  30.91 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  29.66 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  30.05 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  30.85 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  30.79 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  31.99 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  31.88 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  30.19 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  29.82 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  31.25 
 
 		 401 aa  163  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  30.11 
 
 		 398 aa  162  9e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  29.92 
 
 		 388 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  33.93 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  29.66 
 
 		 387 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  32.74 
 
 		 393 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  33.43 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  29.66 
 
 		 387 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  29.68 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  32.05 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  31.47 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  29.26 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.08 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  30.1 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  26.75 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  30.21 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  33.14 
 
 		 387 aa  160  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  31.71 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  29.13 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  31.17 
 
 		 393 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  31.35 
 
 		 396 aa  160  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  29.4 
 
 		 399 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  28.69 
 
 		 390 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  32.77 
 
 		 367 aa  160  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>