More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01913 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 395 aa  795    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  79.37 
 
 		 399 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  80.52 
 
 		 403 aa  617  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  76.96 
 
 		 410 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  74.74 
 
 		 408 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  73.97 
 
 		 408 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  75.53 
 
 		 402 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  72.7 
 
 		 400 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  74.34 
 
 		 400 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  72.7 
 
 		 400 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  74.6 
 
 		 400 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  72.7 
 
 		 400 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  60.21 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  59.32 
 
 		 385 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  55.81 
 
 		 388 aa  425  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  56.63 
 
 		 395 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  55.38 
 
 		 385 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  57.32 
 
 		 402 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  55.32 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  57.07 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  55.38 
 
 		 384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  45.12 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  44.85 
 
 		 398 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  42.86 
 
 		 388 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  43.78 
 
 		 388 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  45.36 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  45.12 
 
 		 406 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  43.05 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  44.05 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  43.13 
 
 		 388 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  41.78 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  41.36 
 
 		 410 aa  279  6e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  41.95 
 
 		 381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  37.67 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  36.27 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  35.54 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  33.6 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  35.05 
 
 		 386 aa  206  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  31.18 
 
 		 387 aa  206  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  37.33 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.66 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  31.88 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  35.98 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  31.3 
 
 		 388 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  36.74 
 
 		 386 aa  196  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  32.8 
 
 		 393 aa  196  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 		 392 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  32.87 
 
 		 375 aa  196  7e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  33.52 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  30.63 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  30.51 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  33.08 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  32.31 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  33.92 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  32.6 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  32.38 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  32.79 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.23 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  35.29 
 
 		 384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  32.59 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  32.59 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  29.82 
 
 		 387 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  30.83 
 
 		 386 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  35.81 
 
 		 393 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  32.19 
 
 		 393 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  35.46 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  29.47 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  35.73 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  34.91 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  30 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  32.81 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  30 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  31.3 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  33.24 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  30 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  33.87 
 
 		 367 aa  187  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  33.77 
 
 		 379 aa  187  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  29.72 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  29.47 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  29.72 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  33.52 
 
 		 387 aa  186  8e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  36.97 
 
 		 392 aa  186  8e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  29.87 
 
 		 396 aa  186  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  29.72 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  29.46 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  29.74 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  29.46 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  29.46 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  29.46 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  29.74 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  29.74 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  30.29 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  31.03 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  31.05 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  30.31 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  29.55 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  32.47 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  30.81 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  32.96 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>