More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2825 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  80.78 
 
 
410 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  100 
 
 
408 aa  827    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  92.16 
 
 
408 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  74.74 
 
 
395 aa  592  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  72.7 
 
 
399 aa  587  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  72.98 
 
 
403 aa  585  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  72.21 
 
 
400 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  72.98 
 
 
402 aa  564  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  71.5 
 
 
400 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  72.21 
 
 
400 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  72.21 
 
 
400 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  71.83 
 
 
400 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  57.47 
 
 
388 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  54.9 
 
 
388 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  54.99 
 
 
385 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  55.39 
 
 
395 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  54.64 
 
 
384 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  53.35 
 
 
385 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  54.66 
 
 
402 aa  398  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  54.66 
 
 
402 aa  398  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  51.79 
 
 
390 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  41.99 
 
 
395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  42.13 
 
 
427 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  42.6 
 
 
406 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  42.3 
 
 
398 aa  293  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  40.63 
 
 
388 aa  292  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  42.04 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  40.37 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  40.31 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  40.58 
 
 
388 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  39.95 
 
 
403 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  39.13 
 
 
410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  35.77 
 
 
412 aa  212  7.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  32.91 
 
 
390 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  34.99 
 
 
387 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  34.62 
 
 
386 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  31.11 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  37.91 
 
 
381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  34.46 
 
 
382 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  30.85 
 
 
392 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  32.05 
 
 
393 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  30.2 
 
 
387 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  30.2 
 
 
387 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  31.98 
 
 
386 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  33.42 
 
 
444 aa  193  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  31.76 
 
 
401 aa  192  7e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  32.91 
 
 
393 aa  192  8e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  29.85 
 
 
385 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  29.7 
 
 
387 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  36.19 
 
 
397 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  29.95 
 
 
387 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  29.7 
 
 
387 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  29.95 
 
 
387 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  29.95 
 
 
387 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  29.95 
 
 
387 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  32.05 
 
 
393 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  35.05 
 
 
381 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  31.27 
 
 
388 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  32.53 
 
 
390 aa  190  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  34.81 
 
 
388 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  31.2 
 
 
388 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  29.21 
 
 
387 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  32.23 
 
 
390 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  32.31 
 
 
404 aa  189  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  34.58 
 
 
392 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  33.97 
 
 
393 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  29.7 
 
 
396 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  31.07 
 
 
391 aa  186  9e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  30.16 
 
 
375 aa  186  9e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  32.82 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  31.78 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  29.7 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  29.21 
 
 
396 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  27.91 
 
 
387 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  33.68 
 
 
379 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  28.96 
 
 
396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  28.96 
 
 
396 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  29.14 
 
 
396 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  31.71 
 
 
388 aa  182  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  33.88 
 
 
386 aa  182  8.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  32.26 
 
 
387 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  28.96 
 
 
396 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  31.83 
 
 
395 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  28.71 
 
 
396 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  28.71 
 
 
396 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  28.71 
 
 
396 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  28.71 
 
 
396 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  31.51 
 
 
392 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  31.97 
 
 
391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  34.42 
 
 
382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  32.04 
 
 
387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  30.63 
 
 
392 aa  180  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  32.7 
 
 
389 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  33.75 
 
 
388 aa  180  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  27.5 
 
 
387 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  29.83 
 
 
392 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  29.9 
 
 
387 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  29.64 
 
 
390 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  29.19 
 
 
386 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  30.19 
 
 
377 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>