More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0226 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  100 
 
 
388 aa  789    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  92.76 
 
 
388 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  77.32 
 
 
388 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  74.94 
 
 
395 aa  616  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  59.22 
 
 
388 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  58.06 
 
 
427 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  52.06 
 
 
410 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  47.97 
 
 
401 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  48.21 
 
 
403 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  42.23 
 
 
398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  40.87 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  43.78 
 
 
395 aa  305  7e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  44.8 
 
 
388 aa  294  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  42.36 
 
 
399 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  41.98 
 
 
385 aa  289  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  41.07 
 
 
390 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  42.59 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  41.93 
 
 
400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  41.96 
 
 
400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  41.95 
 
 
403 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  42.19 
 
 
400 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  39.36 
 
 
385 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  41.24 
 
 
410 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  41.11 
 
 
388 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  41.98 
 
 
402 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  41.73 
 
 
400 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  41.73 
 
 
400 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  40.58 
 
 
408 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  41.98 
 
 
402 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  40.49 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  40.37 
 
 
408 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  38.8 
 
 
384 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  40.12 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  32.4 
 
 
386 aa  199  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  31.33 
 
 
386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  36.76 
 
 
390 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  30.05 
 
 
373 aa  192  8e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  35.47 
 
 
393 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  31.84 
 
 
392 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  34.35 
 
 
390 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  32.28 
 
 
393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  36.13 
 
 
392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  32.17 
 
 
387 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  34.38 
 
 
380 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  29.97 
 
 
395 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  32.31 
 
 
392 aa  187  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  33.78 
 
 
388 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  33.43 
 
 
396 aa  186  5e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  32.58 
 
 
412 aa  186  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  31.73 
 
 
392 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  31.71 
 
 
380 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  29.4 
 
 
387 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  28.68 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  29.92 
 
 
396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  29.92 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  35.48 
 
 
400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  30.45 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  31.27 
 
 
375 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  30.18 
 
 
396 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  34.28 
 
 
397 aa  182  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  29.53 
 
 
404 aa  182  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  29.92 
 
 
396 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  32.36 
 
 
370 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  31.49 
 
 
402 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  30.18 
 
 
396 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  29.92 
 
 
396 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  32.23 
 
 
392 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  28.91 
 
 
387 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  29.2 
 
 
387 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  29.2 
 
 
387 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  29.2 
 
 
387 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  29.2 
 
 
387 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  30 
 
 
390 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  32.09 
 
 
390 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  32.23 
 
 
392 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  32.85 
 
 
392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  29.66 
 
 
396 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  29.66 
 
 
396 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  29.66 
 
 
396 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  28.94 
 
 
385 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  29.66 
 
 
396 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  31.02 
 
 
391 aa  180  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  29.2 
 
 
387 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  33.94 
 
 
376 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  31.07 
 
 
386 aa  180  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  29.2 
 
 
387 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  30.4 
 
 
382 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  31.94 
 
 
397 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  32.11 
 
 
385 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  32.15 
 
 
444 aa  179  8e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  30.55 
 
 
380 aa  179  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  31.4 
 
 
393 aa  179  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  28.5 
 
 
375 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  33.43 
 
 
381 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  30.24 
 
 
395 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  29.72 
 
 
377 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  29.72 
 
 
377 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  32.88 
 
 
390 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0746  aminotransferase class I and II  30.65 
 
 
387 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000316977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>