More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1734 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  80.78 
 
 
408 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  100 
 
 
410 aa  827    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  80.77 
 
 
408 aa  658    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  76.96 
 
 
395 aa  598  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  75.72 
 
 
399 aa  599  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  72.52 
 
 
403 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  73.9 
 
 
400 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  73.89 
 
 
402 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  72.28 
 
 
400 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  73.9 
 
 
400 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  73.9 
 
 
400 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  72.02 
 
 
400 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  58.07 
 
 
385 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  58.12 
 
 
388 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  57.14 
 
 
395 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  55.38 
 
 
388 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  54.38 
 
 
390 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  55.12 
 
 
384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  54.07 
 
 
385 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  56.33 
 
 
402 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  55.83 
 
 
402 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  42.65 
 
 
427 aa  312  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  43.14 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  41.39 
 
 
388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  42.33 
 
 
406 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  42.47 
 
 
388 aa  292  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  42.13 
 
 
395 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  41.85 
 
 
388 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  41.24 
 
 
388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  41.54 
 
 
401 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  42.25 
 
 
403 aa  280  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  39.9 
 
 
410 aa  279  6e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  40 
 
 
381 aa  221  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  36.18 
 
 
412 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  32.38 
 
 
392 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  32.12 
 
 
392 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  31.23 
 
 
388 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  33.96 
 
 
387 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  33.7 
 
 
392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  32.66 
 
 
391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  31.47 
 
 
390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  29.2 
 
 
387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  32.73 
 
 
404 aa  196  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  34.7 
 
 
393 aa  195  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  36.26 
 
 
382 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  34.1 
 
 
379 aa  194  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  32.81 
 
 
386 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  29.2 
 
 
407 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 
405 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  33.77 
 
 
388 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  33.85 
 
 
444 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  31.84 
 
 
393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.05 
 
 
396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  30.57 
 
 
391 aa  190  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  30.26 
 
 
388 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  32.11 
 
 
393 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  35.89 
 
 
381 aa  189  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  31.59 
 
 
375 aa  189  8e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  32.37 
 
 
387 aa  189  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  32.43 
 
 
399 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  32.75 
 
 
392 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  31.27 
 
 
386 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  31.72 
 
 
390 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  32.69 
 
 
395 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  30.69 
 
 
392 aa  186  5e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  34.12 
 
 
382 aa  186  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  29.29 
 
 
396 aa  186  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  30.41 
 
 
386 aa  186  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  35.34 
 
 
393 aa  186  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  29.29 
 
 
396 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  32.05 
 
 
401 aa  186  9e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  30.36 
 
 
397 aa  186  9e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  29.29 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  29.29 
 
 
396 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  29.04 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  29.04 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  35.77 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  29.04 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  29.87 
 
 
387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  34.92 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  32.43 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  29.04 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  33.77 
 
 
386 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  33.51 
 
 
367 aa  184  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  30.87 
 
 
380 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  30.2 
 
 
396 aa  184  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  28.65 
 
 
375 aa  184  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  30.73 
 
 
390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  32.82 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  31.86 
 
 
400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  31.96 
 
 
388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  29.22 
 
 
396 aa  183  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  28.83 
 
 
387 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  28.68 
 
 
387 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  28.68 
 
 
387 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  30.98 
 
 
396 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  31.58 
 
 
390 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  29.43 
 
 
399 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  32.88 
 
 
387 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  31.68 
 
 
387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>